metaFlye: scalable long-read metagenome assembly using repeat graphs

Kolmogorov, M., Bickhart, D. M., Behsaz, B., Гуревич, А. А., Райко, М. П., Shin, S. B., Kuhn, K., Yuan, J., Polevikov, E., Smith, T. P. L. & Певзнер, П. А., 1 ноя 2020, в: Nature Methods. 17, 11, стр. 1103-1110 8 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Draft genome of Bugula neritina, a colonial animal packing powerful symbionts and potential medicines

Райко, М. П., 20 окт 2020, в: Nature Scientific Data. 7, 1, 5 стр., 356.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Feature-based molecular networking in the GNPS analysis environment

Nothias, L. F., Petras, D., Schmid, R., Dührkop, K., Rainer, J., Sarvepalli, A., Protsyuk, I., Ernst, M., Tsugawa, H., Fleischauer, M., Aicheler, F., Aksenov, A. A., Alka, O., Allard, P. M., Barsch, A., Cachet, X., Caraballo-Rodriguez, A. M., Da Silva, R. R., Dang, T., Garg, N. еще 30, Gauglitz, J. M., Gurevich, A., Isaac, G., Jarmusch, A. K., Kameník, Z., Kang, K. B., Kessler, N., Koester, I., Korf, A., Le Gouellec, A., Ludwig, M., Martin H, C., McCall, L. I., McSayles, J., Meyer, S. W., Mohimani, H., Morsy, M., Moyne, O., Neumann, S., Neuweger, H., Nguyen, N. H., Nothias-Esposito, M., Paolini, J., Phelan, V. V., Pluskal, T., Quinn, R. A., Rogers, S., Shrestha, B., Tripathi, A. & van der Hooft, J. J. J., сен 2020, в: Nature Methods. 17, 9, стр. 905-908 4 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Seed transcriptome annotation reveals enhanced expression of genes related to ros homeostasis and ethylene metabolism at alternating temperatures in wild cardoon

Huarte, H. R., Puglia, G. D., Prjibelski, A. D. & Raccuia, S. A., сен 2020, в: Plants. 9, 9, стр. 1-19 19 стр., 1225.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Hybrid transcriptome sequencing approach improved assembly and gene annotation in Cynara cardunculus (L.)

Puglia, G. D., Prjibelski, A. D., Vitale, D., Bushmanova, E., Schmid, K. J. & Raccuia, S. A., 21 авг 2020, в: BMC Genomics. 21, 1, 17 стр., 317.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Correction to: CDSnake: Snakemake pipeline for retrieval of annotated OTUs from paired-end reads using CD-HIT utilities

Kondratenko, Y., Korobeynikov, A. & Lapidus, A., 19 авг 2020, в: BMC Bioinformatics. 21, 1, 1 стр., 362.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › комментарий, выступление › Рецензирование

CDSnake: Snakemake pipeline for retrieval of annotated OTUs from paired-end reads using CD-HIT utilities

Kondratenko, Y., Korobeynikov, A. & Lapidus, A., 24 июл 2020, в: BMC Bioinformatics. 21, 303.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Extending rnaSPAdes functionality for hybrid transcriptome assembly

Prjibelski, A. D., Puglia, G. D., Antipov, D., Bushmanova, E., Giordano, D., Mikheenko, A., Vitale, D. & Lapidus, A., 24 июл 2020, в: BMC Bioinformatics. 21, Suppl 12, стр. 302 9 стр., 302.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

SPAligner: Alignment of long diverged molecular sequences to assembly graphs

Dvorkina, T., Antipov, D., Korobeynikov, A. & Nurk, S., 24 июл 2020, в: BMC Bioinformatics. 21, Suppl 12, 306.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование