1. 2014
  2. Genome sequence of the mud-dwelling archaeon Methanoplanus limicola type strain (DSM 2279(T)), reclassification of Methanoplanus petrolearius as Methanolacinia petrolearia and emended descriptions of the genera Methanoplanus and Methanolacinia

    Göker, M., Lu, M., Fiebig, A., Nolan, M., Lapidus, A., Tice, H., Del Rio, T. G., Cheng, J-F., Han, C., Tapia, R., Goodwin, L. A., Pitluck, S., Liolios, K., Mavromatis, K., Pagani, I., Ivanova, N., Mikhailova, N., Pati, A., Chen, A., Palaniappan, K. еще 14, Land, M., Mayilraj, S., Rohde, M., Detter, J. C., Bunk, B., Spring, S., Wirth, R., Woyke, T., Bristow, J., Eisen, J. A., Markowitz, V., Hugenholtz, P., Kyrpides, N. C. & Klenk, H-P., 2014, в: Standards in Genomic Sciences. 9, 3, стр. 1076-1088

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

  3. Genome sequence of the Thermotoga thermarum type strain (LA3(T)) from an African solfataric spring

    Göker, M., Spring, S., Scheuner, C., Anderson, I., Zeytun, A., Nolan, M., Lucas, S., Tice, H., Del Rio, TG., Cheng, JF., Han, C., Tapia, R., Goodwin, LA., Pitluck, S., Liolios, K., Mavromatis, K., Pagani, I., Ivanova, N., Mikhailova, N., Pati, A. еще 16, Chen, A., Palaniappan, K., Land, M., Hauser, L., Chang, YJ., Jeffries, CD., Rohde, M., Detter, JC., Woyke, T., Bristow, J., Eisen, JA., Markowitz, V., Hugenholtz, P., Kyrpides, NC., Klenk, HP. & Lapidus, A., 2014, в: Standards in Genomic Sciences. 9, стр. 1105-1117

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

  4. Genome-wide Mycobacterium tuberculosis variation (GMTV) database: a new tool for integrating sequence variations and epidemiology

    Chernyaeva, E. N., Shulgina, M. V., Rotkevich, M. S., Dobrynin, P. V., Simonov, S. A., Shitikov, E. A., Ischenko, D. S., Karpova, I. Y., Kostryukova, E. S., Ilina, E. N., Govorun, V. M., Zhuravlev, V. Y., Manicheva, O. A., Yablonsky, P. K., Isaeva, Y. D., Nosova, E. Y., Mokrousov, I. V., Vyazovaya, A. A., Narvskaya, O. V., Lapidus, A. L. еще 1, O'Brien, S. J., 2014, в: BMC Genomics. 15, 308, стр. 1-8

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

  5. Genomic encyclopedia of bacteria and archaea: sequencing a myriad of type strains

    Kyrpides, N. C., Hugenholtz, P., Eisen, J. A., Woyke, T., Göker, M., Parker, C. T., Amann, R., Beck, B. J., Chain, P. S. G., Chun, J., Colwell, R. R., Danchin, A., Dawyndt, P., Dedeurwaerdere, T., DeLong, E. F., Detter, J. C., De Vos, P., Donohue, T. J., Dong, X-Z., Ehrlich, D. S. еще 44, Fraser, C., Gibbs, R., Gilbert, J., Gilna, P., Glöckner, F. O., Jansson, J. K., Keasling, J. D., Knight, R., Labeda, D., Lapidus, A., Lee, J-S., Li, W-J., Ma, J., Markowitz, V., Moore, E. R. B., Morrison, M., Meyer, F., Nelson, K. E., Ohkuma, M., Ouzounis, C. A., Pace, N., Parkhill, J., Qin, N., Rossello-Mora, R., Sikorski, J., Smith, D., Sogin, M., Stevens, R., Stingl, U., Suzuki, K-I., Taylor, D., Tiedje, J. M., Tindall, B., Wagner, M., Weinstock, G., Weissenbach, J., White, O., Wang, J., Zhang, L., Zhou, Y-G., Field, D., Whitman, W. B., Garrity, G. M. & Klenk, H-P., 2014, в: PLoS Biology. 12, 8, стр. 1-7

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

  6. High quality draft genome sequence of Olivibacter sitiensis type strain (AW-6(T)), a diphenol degrader with genes involved in the catechol pathway

    Ntougias, S., Lapidus, A., Han, J., Mavromatis, K., Pati, A., Chen, A., Klenk, H-P., Woyke, T., Fasseas, C., Kyrpides, N. C. & Zervakis, G. I., 2014, в: Standards in Genomic Sciences. 9, 3, стр. 783-93 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  7. Whole genome sequencing of Mycobacterium tuberculosis strains obtained from patients with pulmonary and extrapulmonary tuberculosis

    Chernyaeva, E., Rotkevich, M., Solovieva, N., Zhuravlev, V., Lapidus, A. & O'Brien, S., 2014, The International Journal of Tuberculosis and Lung Disease. S156

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  8. 2013
  9. Genome sequence and emended description of Leisingera nanhaiensis strain DSM 24252T isolated from marine sediment

    Breider, S., Teshima, H., Petersen, J., Chertkov, O., Dalingault, H., Chen, A., Pati, A., Ivanova, N., Lapidus, A., Goodwin, L. A., Chain, P., Detter, J. C., Rohde, M., Tindall, B. J., Kyrpides, N. C., Woyke, T., Simon, M., Göker, M., Klenk, H. P. & Brinkhoff, T., 1 дек 2013, в: Standards in Genomic Sciences. 9, 3

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  10. Genome sequence of Phaeobacter daeponensis type strain (DSM 23529T), a facultatively anaerobic bacterium isolated from marine sediment, and emendation of Phaeobacter daeponensis

    Dogs, M., Teshima, H., Petersen, J., Fiebig, A., Chertkov, O., Dalingault, H., Chen, A., Pati, A., Goodwin, L. A., Chain, P., Detter, J. C., Ivanova, N., Lapidus, A., Rohde, M., Gronow, S., Kyrpides, N. C., Woyke, T., Simon, M., Göker, M., Klenk, H. P. еще 1, Brinkhoff, T., 11 ноя 2013, в: Standards in Genomic Sciences. 9, 1, стр. 142-159 18 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  11. Erratum: Genome sequence of the button mushroom Agaricus bisporus reveals mechanisms governing adaptation to a humic-rich ecological niche

    Morin, E., Kohler, A., Baker, A. R., Foulongne-Oriol, M., Lombard, V., Nagy, L. G., Ohm, R. A., Patyshakuliyeva, A., Brun, A., Aerts, A. L., Bailey, A. M., Billette, C., Coutinho, P. M., Deakin, G., Doddapaneni, H., Floudas, D., Grimwood, J., Hildén, K., Kües, U., Labutti, K. M. еще 23, Lapidus, A., Lindquist, E. A., Lucas, S. M., Murat, C., Riley, R. W., Salamov, A. A., Schmutz, J., Subramanian, V., Wösten, H. A. B., Xu, J., Eastwood, D. C., Foster, G. D., Sonnenberg, A. S. M., Cullen, D., De Vries, R. P., Lundell, T., Hibbett, D. S., Henrissat, B., Burton, K. S., Kerrigan, R. W., Challen, M. P., Grigoriev, I. V. & Martin, F., 5 мар 2013, в: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 110, 10, стр. 17501-17506 1 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхкомментарий, выступлениеРецензирование

  12. Assembling genomes and mini-metagenomes from highly chimeric reads

    Nurk, S., Bankevich, A., Antipov, D., Gurevich, A., Korobeynikov, A., Lapidus, A., Prjibelsky, A., Pyshkin, A., Sirotkin, A., Sirotkin, Y., Stepanauskas, R., McLean, J., Lasken, R., Clingenpeel, S. R., Woyke, T., Tesler, G., Alekseyev, M. A. & Pevzner, P. A., 2013, Research in Computational Molecular Biology - 17th Annual International Conference, RECOMB 2013, Proceedings. стр. 158-170 13 стр. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics); том 7821 LNBI).

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

ID: 209717