Comparative genomics of biotechnologically important yeasts

Riley, R., Haridas, S., Wolfe, K. H., Lopes, M. R., Hittinger, C. T., Göker, M., Salamov, A. A., Wisecaver, J. H., Long, T. M., Calvey, C. H., Aerts, A. L., Barry, K. W., Choi, C., Clum, A., Coughlan, A. Y., Deshpande, S., Douglass, A. P., Hanson, S. J., Klenk, H. P., La Butti, K. M. еще 19, Lapidus, A., Lindquist, E. A., Lipzen, A. M., Meier-Kolthoff, J. P., Ohm, R. A., Otillar, R. P., Pangilinan, J. L., Peng, Y., Rokas, A., Rosa, C. A., Scheuner, C., Sibirny, A. A., Slot, J. C., Stielow, J. B., Sun, H., Kurtzman, C. P., Blackwell, M., Grigoriev, I. V. & Jeffries, T. W., 30 авг 2016, в: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 113, 35, стр. 9882-9887 6 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

RnaQUAST: A quality assessment tool for de novo transcriptome assemblies

Bushmanova, E., Antipov, D., Lapidus, A., Suvorov, V. & Prjibelski, A. D., 15 июл 2016, в: Bioinformatics. 32, 14, стр. 2210-2212 3 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Comparing polysaccharide decomposition between the type strains Gramella echinicola KMM 6050^T (DSM 19838^T) and Gramella portivictoriae UST040801-001^T (DSM 23547^T), and emended description of Gramella echinicola Nedashkovskaya et al. 2005 emend. Shahina et al. 2014 and Gramella portivictoriae Lau et al. 2005

Panschin, I., Huang, S., Meier-Kolthoff, J. P., Tindall, B. J., Rohde, M., Verbarg, S., Lapidus, A., Han, J., Trong, S., Haynes, M., Reddy, T. B. K., Huntemann, M., Pati, A., Ivanova, N. N., Mavromatis, K., Markowitz, V., Woyke, T., Göker, M., Klenk, H. P., Kyrpides, N. C. еще 1, Hahnke, R. L., 3 июн 2016, в: Standards in Genomic Sciences. 11, 1, 37.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Transposable Elements versus the Fungal Genome: Impact on Whole-Genome Architecture and Transcriptional Profiles

Castanera, R., Lopez-Varas, L., Borgognone, A., LaButti, K., Lapidus, A., Schmutz, J., Grimwood, J., Perez, G., Pisabarro, A. G., Grigoriev, I. V., Stajich, J. E. & Ramirez, L., 1 июн 2016, в: PLoS Genetics. 12, 6, 27 стр., e1006108.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Complete genome sequence of Methanospirillum hungatei type strain JF1

Gunsalus, R. P., Cook, L. E., Crable, B., Rohlin, L., McDonald, E., Mouttaki, H., Sieber, J. R., Poweleit, N., Zhou, H., Lapidus, A. L., Daligault, H. E., Land, M., Gilna, P., Ivanova, N., Kyrpides, N., Culley, D. E. & McInerney, M. J., 6 янв 2016, в: Standards in Genomic Sciences. 11, 1, 2.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Complete Genome Sequence of Alkaliphilus metalliredigens Strain QYMF, an Alkaliphilic and Metal-Reducing Bacterium Isolated from Borax-Contaminated Leachate Ponds

Hwang, C., Copeland, A., Lucas, S., Лапидус, А., Barry, K., Detter, J. C., Glavina Del Rio, T., Hammon, N., Israni, S., Dalin, E., Tice, H., Pitluck, S., Chertkov, O., Brettin, T., Bruce, D., Han, C., Schmutz, J., Larimer, F., Land, M. L., Hauser, L. еще 5, Kyrpides, N., Ye, Q., Zhou, J., Richardson, P. & Fields, M. W., 2016, в: Genome Announcements. 4, 6

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Complete genome sequence of Desulfurivibrio alkaliphilus strain AHT2(T), a haloalkaliphilic sulfidogen from Egyptian hypersaline alkaline lakes

Melton, E. D., Sorokin, D. Y., Overmars, L., Chertkov, O., Clum, A., Pillay, M., Ivanova, N., Shapiro, N., Kyrpides, N. C., Woyke, T., Lapidus, A. L. & Muyzer, G., 2016, в: Standards in Genomic Sciences. 11, 9 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Complete genome sequence of the haloalkaliphilic, obligately chemolithoautotrophic thiosulfate and sulfide-oxidizing γ-proteobacterium Thioalkalimicrobium cyclicum type strain ALM 1 (DSM 14477(T))

Kappler, U., Davenport, K., Beatson, S., Lapidus, A., Pan, C., Han, C., Montero-Calasanz, M. D. C., Land, M., Hauser, L., Rohde, M., Göker, M., Ivanova, N., Woyke, T., Klenk, H-P. & Kyrpides, N. C., 2016, в: Standards in Genomic Sciences. 11, 12 стр., 38.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Draft genome of Prochlorothrix hollandica CCAP 1490/1T (CALU1027), the chlorophyll a/b-containing filamentous cyanobacterium: английский

Velichko, N., Rayko, M., Chernyaeva, E., Lapidus, A. & Pinevich, A., 2016, в: Standards in Genomic Sciences. 11, 82, стр. 1-7

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование