Critical Assessment of Metagenome Interpretation - A benchmark of metagenomics software

Sczyrba, A., Hofmann, P., Belmann, P., Koslicki, D., Janssen, S., Dröge, J., Gregor, I., Majda, S., Fiedler, J., Dahms, E., Bremges, A., Fritz, A., Garrido-Oter, R., Jørgensen, T. S., Shapiro, N., Blood, P. D., Gurevich, A., Bai, Y., Turaev, D., Demaere, M. Z. еще 47, Chikhi, R., Nagarajan, N., Quince, C., Meyer, F., Balvočiutė, M., Hansen, L. H., Sørensen, S. J., Chia, B. K. H., Denis, B., Froula, J. L., Wang, Z., Egan, R., Don Kang, D., Cook, J. J., Deltel, C., Beckstette, M., Lemaitre, C., Peterlongo, P., Rizk, G., Lavenier, D., Wu, Y. W., Singer, S. W., Jain, C., Strous, M., Klingenberg, H., Meinicke, P., Barton, M. D., Lingner, T., Lin, H. H., Liao, Y. C., Silva, G. G. Z., Cuevas, D. A., Edwards, R. A., Saha, S., Piro, V. C., Renard, B. Y., Pop, M., Klenk, H. P., Göker, M., Kyrpides, N. C., Woyke, T., Vorholt, J. A., Schulze-Lefert, P., Rubin, E. M., Darling, A. E., Rattei, T. & McHardy, A. C., 31 окт 2017, в: Nature Methods. 14, 11, стр. 1063-1071 9 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Metabolic Fingerprints from the Human Oral Microbiome Reveal a Vast Knowledge Gap of Secreted Small Peptidic Molecules

Edlund, A., Garg, N., Mohimani, H., Gurevich, A., He, X., Shi, W., Dorrestein, P. C. & McLean, J. S., 29 авг 2017, в: mSystems. 2, 4, e00058.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Dereplication of peptidic natural products through database search of mass spectra

Mohimani, H., Gurevich, A., Mikheenko, A., Garg, N., Nothias, L. F., Ninomiya, A., Takada, K., Dorrestein, P. C. & Pevzner, P. A., 1 янв 2017, в: Nature Chemical Biology. 13, 1, стр. 30-37 8 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Icarus: Visualizer for de novo assembly evaluation

Mikheenko, A., Valin, G., Prjibelski, A., Saveliev, V. & Gurevich, A., 1 ноя 2016, в: Bioinformatics. 32, 21, стр. 3321-3323 3 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Spatial molecular architecture of the microbial community of a Peltigera lichen

Garg, N., Zeng, Y., Edlund, A., Melnik, A. V., Sanchez, L. M., Mohimani, H., Gurevich, A., Miao, V., Schiffler, S., Lim, Y. W., Luzzatto-Knaan, T., Cai, S., Rohwer, F., Pevzner, P. A., Cichewicz, R. H., Alexandrov, T. & Dorrestein, P. C., 1 ноя 2016, в: mSystems. 1, 6, e00139.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

MetaQUAST: evaluation of metagenome assemblies.

Mikheenko, A., Saveliev, V. & Gurevich, A., 2016, в: Bioinformatics. 32, 7, стр. 1088-1090

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Assembling short reads from jumping libraries with large insert sizes

Vasilinetc, I., Prjibelski, A. D., Gurevich, A., Korobeynikov, A. & Pevzner, P. A., 2015, в: Bioinformatics. 31, 20, стр. 3262-3268

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья

ExSPAnder: a universal repeat resolver for DNA fragment assembly

Prjibelski, A. D., Vasilinetc, I., Bankevich, A., Gurevich, A., Krivosheeva, T., Nurk, S., Pham, S., Korobeynikov, A., Lapidus, A. & Pevzner, P. A., 2014, в: Bioinformatics. 30, 12, стр. I293-I301

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья