Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Исследование филогенетических связей диких и культурных видов овса (Avena L.). / Родионов, Александр Викентьевич; Гнутиков, Александр Александрович; Носов, Николай Николаевич; Блинова, Е.В. ; Лоскутов, Игорь Градиславович.
In: Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, Vol. 21, No. 2, 17.11.2022, p. 16-20.Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
}
TY - JOUR
T1 - Исследование филогенетических связей диких и культурных видов овса (Avena L.)
AU - Родионов, Александр Викентьевич
AU - Гнутиков, Александр Александрович
AU - Носов, Николай Николаевич
AU - Блинова, Е.В.
AU - Лоскутов, Игорь Градиславович
N1 - Гнутиков А. А., Носов Н. Н., Лоскутов И. Г., Блинова Е. В., Родионов А. В. Исследование филогенетических связей диких и культурных видов овса (Avena L.) // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, 2022. Т. 21, №2. С. 16-20.
PY - 2022/11/17
Y1 - 2022/11/17
N2 - Проведено секвенирование следующего поколения (NGS) на платформе Illumina последовательности ITS1 и начала гена 5.8S рРНК образцов диких и культивируемых видов рода Avena L.Впервые методом NGS проведен филогенетический анализ путей одомашнивания трех культурных видов овса: тетраплоидного A. abyssinica (AB) и гексаплоидных A. sativa и A. byzantina (ACD). Нами выявлено, что наиболее массовый по количеству ридов (прочтений) геном A. abyssinica – это A-геном, а у A. sativa – D-геном. Изучены также предполагаемые пути получения геномов полиплоидов от диплоидных видов. По данным NGS-секвенирования было выявлено, что наиболее массовый риботип A. sativa унаследован от A. ludoviciana, A. byzantina обладает двумя уникальными семействами риботипов, а A. abyssinica, вероятно, происходит от дикорастущего A. vaviloviana, при этом A-геном получен этим видом от диплоидного A. atlantica (As-геном). Предполагаемый предок A. abyssinica, тетраплоид A. agadiriana, формирует уникальные семейства риботипов, к которым принадлежит самый массовый риботип. Скорее всего, он не был прямым предком A. abyssinica. C-геномный вид A. clauda оказался родственным D-геному A. sativa, он также мог принимать участие в формировании гексаплоида A. ludoviciana.
AB - Проведено секвенирование следующего поколения (NGS) на платформе Illumina последовательности ITS1 и начала гена 5.8S рРНК образцов диких и культивируемых видов рода Avena L.Впервые методом NGS проведен филогенетический анализ путей одомашнивания трех культурных видов овса: тетраплоидного A. abyssinica (AB) и гексаплоидных A. sativa и A. byzantina (ACD). Нами выявлено, что наиболее массовый по количеству ридов (прочтений) геном A. abyssinica – это A-геном, а у A. sativa – D-геном. Изучены также предполагаемые пути получения геномов полиплоидов от диплоидных видов. По данным NGS-секвенирования было выявлено, что наиболее массовый риботип A. sativa унаследован от A. ludoviciana, A. byzantina обладает двумя уникальными семействами риботипов, а A. abyssinica, вероятно, происходит от дикорастущего A. vaviloviana, при этом A-геном получен этим видом от диплоидного A. atlantica (As-геном). Предполагаемый предок A. abyssinica, тетраплоид A. agadiriana, формирует уникальные семейства риботипов, к которым принадлежит самый массовый риботип. Скорее всего, он не был прямым предком A. abyssinica. C-геномный вид A. clauda оказался родственным D-геному A. sativa, он также мог принимать участие в формировании гексаплоида A. ludoviciana.
KW - доместикация
KW - овес
KW - филогения
KW - NGS
KW - ITS 1–2
U2 - 10.14258/pbssm.2022046
DO - 10.14258/pbssm.2022046
M3 - статья
VL - 21
SP - 16
EP - 20
JO - Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии
JF - Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии
SN - 2313-3929
IS - 2
ER -
ID: 100592983