Проведено секвенирование следующего поколения (NGS) на платформе Illumina последовательности ITS1 и начала гена 5.8S рРНК образцов диких и культивируемых видов рода Avena L.
Впервые методом NGS проведен филогенетический анализ путей одомашнивания трех культурных видов овса: тетраплоидного A. abyssinica (AB) и гексаплоидных A. sativa и A. byzantina (ACD). Нами выявлено, что наиболее массовый по количеству ридов (прочтений) геном A. abyssinica – это A-геном, а у A. sativa – D-геном. Изучены также предполагаемые пути получения геномов полиплоидов от диплоидных видов. По данным NGS-секвенирования было выявлено, что наиболее массовый риботип A. sativa унаследован от A. ludoviciana, A. byzantina обладает двумя уникальными семействами риботипов, а A. abyssinica, вероятно, происходит от дикорастущего A. vaviloviana, при этом A-геном получен этим видом от диплоидного A. atlantica (As-геном). Предполагаемый предок A. abyssinica, тетраплоид A. agadiriana, формирует уникальные семейства риботипов, к которым принадлежит самый массовый риботип. Скорее всего, он не был прямым предком A. abyssinica. C-геномный вид A. clauda оказался родственным D-геному A. sativa, он также мог принимать участие в формировании гексаплоида A. ludoviciana.
Translated title of the contributionStudy of phylogenetic relationships between wild and cultivated oat species (Avena L.)
Original languageRussian
Pages (from-to)16-20
Number of pages5
JournalПроблемы ботаники Южной Сибири и Монголии
Volume21
Issue number2
DOIs
StatePublished - 17 Nov 2022

ID: 100592983