Исследование филогенетических связей диких и культурных видов овса (Avena L.)

Standard

Исследование филогенетических связей диких и культурных видов овса (Avena L.). / Родионов, Александр Викентьевич ; Гнутиков, Александр Александрович ; Носов, Николай Николаевич; Блинова, Е.В. ; Лоскутов, Игорь Градиславович.

в: Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, Том 21, № 2, 17.11.2022, стр. 16-20.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

BibTeX

@article{345c254a05814097a0493aa0dd98ed42,

title = "Исследование филогенетических связей диких и культурных видов овса (Avena L.)",

abstract = "Проведено секвенирование следующего поколения (NGS) на платформе Illumina последовательности ITS1 и начала гена 5.8S рРНК образцов диких и культивируемых видов рода Avena L.Впервые методом NGS проведен филогенетический анализ путей одомашнивания трех культурных видов овса: тетраплоидного A. abyssinica (AB) и гексаплоидных A. sativa и A. byzantina (ACD). Нами выявлено, что наиболее массовый по количеству ридов (прочтений) геном A. abyssinica – это A-геном, а у A. sativa – D-геном. Изучены также предполагаемые пути получения геномов полиплоидов от диплоидных видов. По данным NGS-секвенирования было выявлено, что наиболее массовый риботип A. sativa унаследован от A. ludoviciana, A. byzantina обладает двумя уникальными семействами риботипов, а A. abyssinica, вероятно, происходит от дикорастущего A. vaviloviana, при этом A-геном получен этим видом от диплоидного A. atlantica (As-геном). Предполагаемый предок A. abyssinica, тетраплоид A. agadiriana, формирует уникальные семейства риботипов, к которым принадлежит самый массовый риботип. Скорее всего, он не был прямым предком A. abyssinica. C-геномный вид A. clauda оказался родственным D-геному A. sativa, он также мог принимать участие в формировании гексаплоида A. ludoviciana.",

keywords = "доместикация, овес, филогения, NGS, ITS 1–2",

author = "Родионов, {Александр Викентьевич} and Гнутиков, {Александр Александрович} and Носов, {Николай Николаевич} and Е.В. Блинова and Лоскутов, {Игорь Градиславович}",

note = "Гнутиков А. А., Носов Н. Н., Лоскутов И. Г., Блинова Е. В., Родионов А. В. Исследование филогенетических связей диких и культурных видов овса (Avena L.) // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, 2022. Т. 21, №2. С. 16-20. ",

year = "2022",

month = nov,

day = "17",

doi = "10.14258/pbssm.2022046",

language = "русский",

volume = "21",

pages = "16--20",

journal = "Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии",

issn = "2313-3929",

number = "2",

}

RIS

TY - JOUR

T1 - Исследование филогенетических связей диких и культурных видов овса (Avena L.)

AU - Родионов, Александр Викентьевич

AU - Гнутиков, Александр Александрович

AU - Носов, Николай Николаевич

AU - Блинова, Е.В.

AU - Лоскутов, Игорь Градиславович

N1 - Гнутиков А. А., Носов Н. Н., Лоскутов И. Г., Блинова Е. В., Родионов А. В. Исследование филогенетических связей диких и культурных видов овса (Avena L.) // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии, 2022. Т. 21, №2. С. 16-20.

PY - 2022/11/17

Y1 - 2022/11/17

N2 - Проведено секвенирование следующего поколения (NGS) на платформе Illumina последовательности ITS1 и начала гена 5.8S рРНК образцов диких и культивируемых видов рода Avena L.Впервые методом NGS проведен филогенетический анализ путей одомашнивания трех культурных видов овса: тетраплоидного A. abyssinica (AB) и гексаплоидных A. sativa и A. byzantina (ACD). Нами выявлено, что наиболее массовый по количеству ридов (прочтений) геном A. abyssinica – это A-геном, а у A. sativa – D-геном. Изучены также предполагаемые пути получения геномов полиплоидов от диплоидных видов. По данным NGS-секвенирования было выявлено, что наиболее массовый риботип A. sativa унаследован от A. ludoviciana, A. byzantina обладает двумя уникальными семействами риботипов, а A. abyssinica, вероятно, происходит от дикорастущего A. vaviloviana, при этом A-геном получен этим видом от диплоидного A. atlantica (As-геном). Предполагаемый предок A. abyssinica, тетраплоид A. agadiriana, формирует уникальные семейства риботипов, к которым принадлежит самый массовый риботип. Скорее всего, он не был прямым предком A. abyssinica. C-геномный вид A. clauda оказался родственным D-геному A. sativa, он также мог принимать участие в формировании гексаплоида A. ludoviciana.

AB - Проведено секвенирование следующего поколения (NGS) на платформе Illumina последовательности ITS1 и начала гена 5.8S рРНК образцов диких и культивируемых видов рода Avena L.Впервые методом NGS проведен филогенетический анализ путей одомашнивания трех культурных видов овса: тетраплоидного A. abyssinica (AB) и гексаплоидных A. sativa и A. byzantina (ACD). Нами выявлено, что наиболее массовый по количеству ридов (прочтений) геном A. abyssinica – это A-геном, а у A. sativa – D-геном. Изучены также предполагаемые пути получения геномов полиплоидов от диплоидных видов. По данным NGS-секвенирования было выявлено, что наиболее массовый риботип A. sativa унаследован от A. ludoviciana, A. byzantina обладает двумя уникальными семействами риботипов, а A. abyssinica, вероятно, происходит от дикорастущего A. vaviloviana, при этом A-геном получен этим видом от диплоидного A. atlantica (As-геном). Предполагаемый предок A. abyssinica, тетраплоид A. agadiriana, формирует уникальные семейства риботипов, к которым принадлежит самый массовый риботип. Скорее всего, он не был прямым предком A. abyssinica. C-геномный вид A. clauda оказался родственным D-геному A. sativa, он также мог принимать участие в формировании гексаплоида A. ludoviciana.

KW - доместикация

KW - овес

KW - филогения

KW - NGS

KW - ITS 1–2

U2 - 10.14258/pbssm.2022046

DO - 10.14258/pbssm.2022046

M3 - статья

VL - 21

SP - 16

EP - 20

JO - Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии

JF - Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии

SN - 2313-3929

IS - 2

ER -

ID: 100592983