Распознавание кодирующих и некодирующих областей ДНК на основе оптимального набора признаков. / Каюмова, Диана Шамильевна; Широбоков, Михаил Владимирович.
In: ПРОЦЕССЫ УПРАВЛЕНИЯ И УСТОЙЧИВОСТЬ, Vol. 6, No. 1, 2019, p. 178-182.Research output: Contribution to journal › Article
}
TY - JOUR
T1 - Распознавание кодирующих и некодирующих областей ДНК на основе оптимального набора признаков.
AU - Каюмова, Диана Шамильевна
AU - Широбоков, Михаил Владимирович
PY - 2019
Y1 - 2019
N2 - В работе предлагается алгоритм разметки кодирующих и некодирующих участков молекулы ДНК, основанный на методе нахождения оптимального набора признаков. Работа алгоритма рассматривается на примере молекулы ДНК раковой опухоли человека BRCA2-206. Отдельно рассмотрена проблема определения принадлежности участка молекулы ДНК к интронам или экзонам. Для ее решения предложен метод, основанный на TF-IDF разметке в сочетании с байесовским классификатором, принимаюших на вход набор оптимальных признаков. Исследовано поведение работы метода внутри оптимального множества параметров определения множества значимых признаков. С использованием этого метода разработан алгоритм, использующий информацию об экстремумах функции вероятности принадлежности цепочки нуклеотидов к интронам или экзонам для разметки молекулы ДНК.
AB - В работе предлагается алгоритм разметки кодирующих и некодирующих участков молекулы ДНК, основанный на методе нахождения оптимального набора признаков. Работа алгоритма рассматривается на примере молекулы ДНК раковой опухоли человека BRCA2-206. Отдельно рассмотрена проблема определения принадлежности участка молекулы ДНК к интронам или экзонам. Для ее решения предложен метод, основанный на TF-IDF разметке в сочетании с байесовским классификатором, принимаюших на вход набор оптимальных признаков. Исследовано поведение работы метода внутри оптимального множества параметров определения множества значимых признаков. С использованием этого метода разработан алгоритм, использующий информацию об экстремумах функции вероятности принадлежности цепочки нуклеотидов к интронам или экзонам для разметки молекулы ДНК.
KW - bioinformatics
KW - genetics
KW - machine learning
KW - molecular biology
KW - биоинформатика
KW - генетика
KW - машинное обучение
KW - молекулярная биология
KW - bioinformatics
KW - genetics
KW - machine learning
KW - molecular biology
KW - биоинформатика
KW - генетика
KW - машинное обучение
KW - молекулярная биология
M3 - статья
VL - 6
SP - 178
EP - 182
JO - Процессы управления и устойчивость
JF - Процессы управления и устойчивость
SN - 2313-7304
IS - 1
ER -
ID: 78392898