Дрожжи Komagataella phaffii играют важную роль в современной биотехнологии как продуцент рекомбинантного белка. Для эффективного использования этих дрожжей необходимо изучать влияние различных компонентов среды на их рост и экспрессию генов. В этой работе исследовали влияние метионина на экспрессию генов в клетках K. phaffii с помощью методов высокопроизводительного секвенирования РНК. Несколько групп генов проявляли дифференцированную экспрессию при культивировании клеток K. phaffii в среде с метанолом и метионином по сравнению со средой без этой аминокислоты. Метионин в первую очередь влиял на экспрессию генов, участвующих в его биосинтезе, метаболизме жирных кислот и утилизации метанола. Промотор гена AOX1, который широко используется для гетерологичной экспрессии в K. phaffii, подавляется в средах, содержащих метионин. Несмотря на большой прогресс в разработке методов инженерии штаммов K. phaffii, для достижения высокого выхода целевого продукта требуется точная корректировка условий культивирования. Данные о влиянии метионина на экспрессию генов K. phaffii важны для оптимизации рецептов сред и стратегий культивирования, направленных на максимальное повышение эффективности синтеза рекомбинантных белков.