Standard

Тандемные повторы в геноме свиньи Sus scrofa, их локализация в хромосомах и ядрах клеток сперматогенного ряда. / Иванова, Н.Г.; Стефанова, В.Н.; Остромышенский, Д.И.; Подгорная, О.И.

в: ГЕНЕТИКА, Том 55, № 7, 2019, стр. 798-810.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

Harvard

APA

Vancouver

Author

Иванова, Н.Г. ; Стефанова, В.Н. ; Остромышенский, Д.И. ; Подгорная, О.И. / Тандемные повторы в геноме свиньи Sus scrofa, их локализация в хромосомах и ядрах клеток сперматогенного ряда. в: ГЕНЕТИКА. 2019 ; Том 55, № 7. стр. 798-810.

BibTeX

@article{12e8b67e4ff142f7bc00eb903d820849,
title = "Тандемные повторы в геноме свиньи Sus scrofa, их локализация в хромосомах и ядрах клеток сперматогенного ряда.",
abstract = "Методы биоинформатики позволяют найти и аннотировать большие тандемные повторы (ТП) в сборках геномов разных организмов. В настоящей работе анализировали геномную сборку свиньи Sus scrofa (в базе данных NCBI Sscrofa10.2) и выявили набор ТП, характерных для вида, а также картировали некоторые из них методом FISH на метафазных хромосомах с помощью рассчитанных нами коротких олигонуклеотидных зондов (Sscrf_335A, Sscrf_243A, Sscrf_15A, Sscrf_50A). Все ТП, присутствующие в базе данных Repbase для свиньи, выявляются с помощью биоинформатических методов, но кроме них найдено еще 18 новых семейств ТП в сборке Sscrofa10.2. Набор найденных ТП в сборке Sscrofa10.2 по сравнению с человеком и мышью отличается б{\'o}льшей длиной мономеров. Зонды Sscrf_15А и Sscrf_243А выявляют набор акроцентрических (Ас) хромосом, зонд Sscrf_50А – набор суб/метацентрических (Мс) хромосом, зонд Sscrf_335А метит все хромосомы. Использовали зонды для того, чтобы проследить за укладкой центромерного района при сперматогенезе. При использовании все",
keywords = "chromatin organization, spermFISH., tandem repeat, организация хроматина, тандемные повторы, chromatin organization, spermFISH., tandem repeat, организация хроматина, тандемные повторы",
author = "Н.Г. Иванова and В.Н. Стефанова and Д.И. Остромышенский and О.И. Подгорная",
year = "2019",
language = "русский",
volume = "55",
pages = "798--810",
journal = "ГЕНЕТИКА",
issn = "0016-6758",
publisher = "Международная книга",
number = "7",

}

RIS

TY - JOUR

T1 - Тандемные повторы в геноме свиньи Sus scrofa, их локализация в хромосомах и ядрах клеток сперматогенного ряда.

AU - Иванова, Н.Г.

AU - Стефанова, В.Н.

AU - Остромышенский, Д.И.

AU - Подгорная, О.И.

PY - 2019

Y1 - 2019

N2 - Методы биоинформатики позволяют найти и аннотировать большие тандемные повторы (ТП) в сборках геномов разных организмов. В настоящей работе анализировали геномную сборку свиньи Sus scrofa (в базе данных NCBI Sscrofa10.2) и выявили набор ТП, характерных для вида, а также картировали некоторые из них методом FISH на метафазных хромосомах с помощью рассчитанных нами коротких олигонуклеотидных зондов (Sscrf_335A, Sscrf_243A, Sscrf_15A, Sscrf_50A). Все ТП, присутствующие в базе данных Repbase для свиньи, выявляются с помощью биоинформатических методов, но кроме них найдено еще 18 новых семейств ТП в сборке Sscrofa10.2. Набор найденных ТП в сборке Sscrofa10.2 по сравнению с человеком и мышью отличается бóльшей длиной мономеров. Зонды Sscrf_15А и Sscrf_243А выявляют набор акроцентрических (Ас) хромосом, зонд Sscrf_50А – набор суб/метацентрических (Мс) хромосом, зонд Sscrf_335А метит все хромосомы. Использовали зонды для того, чтобы проследить за укладкой центромерного района при сперматогенезе. При использовании все

AB - Методы биоинформатики позволяют найти и аннотировать большие тандемные повторы (ТП) в сборках геномов разных организмов. В настоящей работе анализировали геномную сборку свиньи Sus scrofa (в базе данных NCBI Sscrofa10.2) и выявили набор ТП, характерных для вида, а также картировали некоторые из них методом FISH на метафазных хромосомах с помощью рассчитанных нами коротких олигонуклеотидных зондов (Sscrf_335A, Sscrf_243A, Sscrf_15A, Sscrf_50A). Все ТП, присутствующие в базе данных Repbase для свиньи, выявляются с помощью биоинформатических методов, но кроме них найдено еще 18 новых семейств ТП в сборке Sscrofa10.2. Набор найденных ТП в сборке Sscrofa10.2 по сравнению с человеком и мышью отличается бóльшей длиной мономеров. Зонды Sscrf_15А и Sscrf_243А выявляют набор акроцентрических (Ас) хромосом, зонд Sscrf_50А – набор суб/метацентрических (Мс) хромосом, зонд Sscrf_335А метит все хромосомы. Использовали зонды для того, чтобы проследить за укладкой центромерного района при сперматогенезе. При использовании все

KW - chromatin organization

KW - spermFISH.

KW - tandem repeat

KW - организация хроматина

KW - тандемные повторы

KW - chromatin organization

KW - spermFISH.

KW - tandem repeat

KW - организация хроматина

KW - тандемные повторы

M3 - статья

VL - 55

SP - 798

EP - 810

JO - ГЕНЕТИКА

JF - ГЕНЕТИКА

SN - 0016-6758

IS - 7

ER -

ID: 78622968