Программа предназначена для выявления сходных пентапептидов в молекулярной мимикрии. С ее помощью можно выравнивать два разных белка в разных организмах (например, шиповидный белок (UniProt ID = P0DTC2) SARS-CoV-2 и человеческий аутоантиген тиреоглобулин (UniProt ID = P01266)). В результате программа выявляет аналогичные пентапептиды в белках, что позволяет применяеть ее в медицинских научных и клинических исследованиях для определения молекулярной мимикрии при аутоиммунных заболеваниях и при производстве вакцин.
Программа обеспечивает выполнение следующих функций:
Ввод данных двумя файлами аминокислотной последовательности в фаста формате, произведение расчетов с использованием алгоритма локального выравнивания и вывод полученных результатов.