На основе определения роли производственной инфраструктуры в системе организации и развития регионального уровня экономики рассматриваются основные методологические подходы к формированию региональных транспортных систем. Анализ опыта развития транспортных систем Северо-Западного федерального округа и Ленинградской области позволяет сделать вывод о необходимости разработки актуализированных методик для решения проблем рационального пространственного развития территорий.