Бесспорно имея семиотическую природу, палимпсесты не вписываются в ахроническое системно-структурное представление знаковых средств, принятое в семиотике. Широкая представленность палимпсестов в биосемиотике и антропосемиотике не даёт возможности рассматривать их как исключение, позволяющее не пересматривать основания общей семиотики. При этом обнаруживается, что в палимпсестах наблюдается превращение парадигматических отношений некоторых компонентов разных уровней в их синтагматические отношения, а сама семиотика палимпсестов может квалифицироваться как семиотика с открытым кодом. Указанное обстоятельство, связанное с ослаблением парадигматических оппозиций и синтагматических связей, определяет статус палимпсестов как инструмента темпоральных изменений знаковых систем (ср. антиномию синхронии - диахронии Ф. де Соссюра) и предполагает оценку величины вклада палимпсестов в эти изменения.