1. 2020
  2. Using SPAdes De Novo Assembler

    Prjibelski, A., Antipov, D., Meleshko, D., Lapidus, A. & Korobeynikov, A., 19 июн 2020, в: Current Protocols in Bioinformatics. 70, 1, e102.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  3. 2019
  4. Extending rnaSPAdes functionality for hybrid transcriptome assembly

    Prjibelski, A., Bushmanova, E., Giordano, D., Mikheenko, A., Puglia, G., Antipov, D., Viatale, D. & Lapidus, A., 8 ноя 2019, в: BMC Bioinformatics. 20, S17, 2 стр., O9.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхтезисыРецензирование

  5. RnaSPAdes: A de novo transcriptome assembler and its application to RNA-Seq data

    Bushmanova, E., Antipov, D., Lapidus, A. & Prjibelski, A. D., 18 сен 2019, в: GigaScience. 8, 9, 13 стр., giz100.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  6. Plasmid detection and assembly in genomic and metagenomic datasets

    Antipov, D., Raiko, M., Lapidus, A. & Pevzner, P. A., 1 янв 2019, в: Genome Research. 29, 6, стр. 961-968 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  7. 2018
  8. Versatile genome assembly evaluation with QUAST-LG

    Mikheenko, A., Prjibelski, A., Saveliev, V., Antipov, D. & Gurevich, A., 1 июл 2018, в: Bioinformatics. 34, 13, стр. i142-i150 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  9. 2016
  10. PlasmidSPAdes: Assembling plasmids from whole genome sequencing data

    Antipov, D., Hartwick, N., Shen, M., Raiko, M., Lapidus, A. & Pevzner, P. A., 15 ноя 2016, в: Bioinformatics. 32, 22, стр. 3380-3387 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  11. RnaQUAST: A quality assessment tool for de novo transcriptome assemblies

    Bushmanova, E., Antipov, D., Lapidus, A., Suvorov, V. & Prjibelski, A. D., 15 июл 2016, в: Bioinformatics. 32, 14, стр. 2210-2212 3 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  12. HybridSPAdes: An algorithm for hybrid assembly of short and long reads

    Antipov, D., Korobeynikov, A., McLean, J. S. & Pevzner, P. A., 1 апр 2016, в: Bioinformatics. 32, 7, стр. 1009-1015 7 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  13. 2013
  14. Assembling genomes and mini-metagenomes from highly chimeric reads

    Nurk, S., Bankevich, A., Antipov, D., Gurevich, A., Korobeynikov, A., Lapidus, A., Prjibelsky, A., Pyshkin, A., Sirotkin, A., Sirotkin, Y., Stepanauskas, R., McLean, J., Lasken, R., Clingenpeel, S. R., Woyke, T., Tesler, G., Alekseyev, M. A. & Pevzner, P. A., 2013, Research in Computational Molecular Biology - 17th Annual International Conference, RECOMB 2013, Proceedings. стр. 158-170 13 стр. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics); том 7821 LNBI).

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференцииРецензирование

  15. Pathset graphs: a novel approach for comprehensive utilization of paired reads in genome assembly

    Pham, S. K., Antipov, D., Sirotkin, A., Tesler, G., Pevzner, P. A. & Alekseyev, M. A., 2013, в: Journal of Computational Biology. 20, 4, стр. 359-371

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатья

ID: 191825