TandemTools: mapping long reads and assessing/improving assembly quality in extra-long tandem repeats

Mikheenko, A., Bzikadze, A., Gurevich, A., Miga, K. & Певзнер, П. А., 1 июл 2020, в: Bioinformatics. 36, 1, стр. i75–i83

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

MetaMiner: A Scalable Peptidogenomics Approach for Discovery of Ribosomal Peptide Natural Products with Blind Modifications from Microbial Communities

Cao, L., Gurevich, A., Alexander, K. L., Naman, C. B., Leão, T., Glukhov, E., Luzzatto-Knaan, T., Vargas, F., Quinn, R., Bouslimani, A., Nothias, L. F., Singh, N. K., Sanders, J. G., Benitez, R. A. S., Thompson, L. R., Hamid, M. N., Morton, J. T., Mikheenko, A., Shlemov, A., Korobeynikov, A. еще 8, Friedberg, I., Knight, R., Venkateswaran, K., Gerwick, W. H., Gerwick, L., Dorrestein, P. C., Pevzner, P. A. & Mohimani, H., 18 дек 2019, в: Cell Systems. 9, 6, стр. 600-608.e4 13 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Extending rnaSPAdes functionality for hybrid transcriptome assembly

Prjibelski, A., Bushmanova, E., Giordano, D., Mikheenko, A., Puglia, G., Antipov, D., Viatale, D. & Lapidus, A., 8 ноя 2019, в: BMC Bioinformatics. 20, S17, 2 стр., O9.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › тезисы › Рецензирование

Assembly Graph Browser: interactive visualization of assembly graphs

Mikheenko, A. & Kolmogorov, M., 15 сен 2019, в: Bioinformatics. 35, 18, стр. 3476-3478 3 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Dereplication of microbial metabolites through database search of mass spectra

Mohimani, H., Гуревич, А. А., Шлемов, А. Ю., Михеенко, А. А., Коробейников, А. И., Cao, L., Щербин, Е., Nothias, L-F., Dorrestein, P. C. & Певзнер, П. А., 1 дек 2018, в: Nature Communications. 9, 1, 12 стр., 4035.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Versatile genome assembly evaluation with QUAST-LG

Mikheenko, A., Prjibelski, A., Saveliev, V., Antipov, D. & Gurevich, A., 1 июл 2018, в: Bioinformatics. 34, 13, стр. i142-i150 9 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Increased diversity of peptidic natural products revealed by modification-tolerant database search of mass spectra

Гуревич, А. А., Михеенко, А. А., Шлемов, А. Ю., Коробейников, А. И., Mohimani, H. & Певзнер, П. А., 1 мар 2018, в: Nature Microbiology. 3, 3, стр. 319-327 9 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Dereplication of peptidic natural products through database search of mass spectra

Mohimani, H., Gurevich, A., Mikheenko, A., Garg, N., Nothias, L. F., Ninomiya, A., Takada, K., Dorrestein, P. C. & Pevzner, P. A., 1 янв 2017, в: Nature Chemical Biology. 13, 1, стр. 30-37 8 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Icarus: Visualizer for de novo assembly evaluation

Mikheenko, A., Valin, G., Prjibelski, A., Saveliev, V. & Gurevich, A., 1 ноя 2016, в: Bioinformatics. 32, 21, стр. 3321-3323 3 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

MetaQUAST: evaluation of metagenome assemblies.

Mikheenko, A., Saveliev, V. & Gurevich, A., 2016, в: Bioinformatics. 32, 7, стр. 1088-1090

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование