Cupin-1.1 Adsorption Layers at the Surface of 8 M Urea Solutions
Исаков, Н. А., Белоусов, М. В., Loglio, G., Миллер, Р., Нижников, А. А., Panda, A. K. & Носков, Б. А., 5 дек 2024, в: Journal of Physical Chemistry B. 128, 48Pathogenesis-associated bacterial amyloids: the network of interactions
Фаюд, Х., Белоусов, М. В., Антонец, К. С. & Нижников, А. А., 1 дек 2024, в: Biochemistry (Moscow). 89, 12-13, стр. 2107-2132Genomic Insights into the Bactericidal and Fungicidal Potential of Bacillus mycoides b12.3 Isolated in the Soil of Olkhon Island in Lake Baikal, Russia
Романенко, М. Н., Шиков, А. Е., Савина, Ю., Шматов, Ф., Нижников, А. А. & Антонец, К. С., 28 ноя 2024, в: Microorganisms. 12, 12, 2450.Whole-Genome Sequencing of Peribacillus frigoritolerans Strain d21.2 Isolated in the Republic of Dagestan, Russia
Романенко, М. Н., Шиков, А. Е., Савина, Ю. А., Нижников, А. А. & Антонец, К. С., 24 ноя 2024, в: Microorganisms. 12, 12, 2410.A new Peribacillus simplex d27.3 strain mediates antimicrobial activity through a combination of secondary metabolites, including fengycins
Baranova, M., Romanenko, M., Savina, I., Pilipenko, E., Belozerova, O., Terekhov, S., Nizhnikov, A., Antonets, K. & Smirnov, I., 10 окт 2024, в: Biological Communications. 69, 2, стр. 111-116 6 стр.Dynamic properties of the layers of cupin-1.1 aggregates at the air/water interface
Исаков, Н. А., Белоусов, М. В., Нижников, А. А. & Носков, Б. А., 1 апр 2024, в: Biophysical Chemistry. 307, 7 стр., 107166.Draft Genome Sequencing of the Bacillus thuringiensis var. Thuringiensis Highly Insecticidal Strain 800/15
Шиков, А. Е., Савина, Ю. А., Романенко, М. Н., Нижников, А. А. & Антонец, К. С., 10 фев 2024, в: Data. 9, 2, 34.Genetic Collections of St. Petersburg University
Андреева, Е. А., Бурлаковский, М. С., Бузовкина, И. С., Чекунова, Е. М., Додуева, И. Е., Голубкова, Е. В., Матвеенко, А. Г., Румянцев, А. М., Цветкова, Н. В., Задорский, С. П. & Нижников, А. А., 30 ноя 2023, в: Biological Communications. 68, 3, стр. 199-214 15 стр.Draft Genome Sequence Data of Lysinibacillus sphaericus Strain 1795 with Insecticidal Properties
Романенко, М. Н., Нестеренко, М. А., Шиков, А. Е., Нижников, А. А. & Антонец, К. С., 3 ноя 2023, в: Data. 8, 11, 167.OmpC and OmpF Outer Membrane Proteins of Escherichia coli and Salmonella enterica Form Bona Fide Amyloids
Белоусов, М. В., Косолапова, А. О., Фаюд, Х., Сулацкий, М. И., Сулацкая, А. И., Романенко, М. Н., Бобылёв, А. Г., Антонец, К. С. & Нижников, А. А., 24 окт 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 21, 22 стр., 15522.Прионы и амилоиды как пространственные матрицы протеома
Инге-Вечтомов, С. Г., Галкин, А. П., Журавлева, Г. А., Нижников, А. А. & Задорский, С. П., 15 сен 2023, в: ВЕСТНИК РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК. 93, 9, стр. 845-854 10 стр.Recombination in Bacterial Genomes: Evolutionary Trends
Шиков, А. Е., Савина, Ю. А., Нижников, А. А. & Антонец, К. С., 12 сен 2023, в: Toxins. 15, 9, 568.The man, the plant, and the insect: shooting host specificity determinants in Serratia marcescens pangenome
Шиков, А. Е., Меркушова, А. В., Савина, Ю. А., Нижников, А. А. & Антонец, К. С., 12 сен 2023, в: Frontiers in Microbiology. 14, 1211999.For Someone, You Are the Whole World: Host-Specificity of Salmonella enterica
Меркушова, А. В., Шиков, А. Е., Нижников, А. А. & Антонец, К. С., 5 сен 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 18, 13670.Amyloid Fibrils of Pisum sativum L. Vicilin Inhibit Pathological Aggregation of Mammalian Proteins
Сулацкий, М. И., Белоусов, М. В., Косолапова, А. О., Михайлова, Е., Романенко, М. Н., Антонец, К. С., Кузнецова, И. М., Туроверов, К., Нижников, А. А. & Сулацкая, А. И., 18 авг 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 16, 21 стр., 12932.Overview of the Special Issue “Protein-Based Infection, Inheritance, and Memory”
Чернов, Ю. О. & Нижников, А. А., 10 июл 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 14, 11280.Salmonella-Based Biorodenticides: Past Applications and Current Contradictions
Shikov, A. E., Belousova, M. E., Belousov, M. V., Nizhnikov, A. A. & Antonets, K. S., дек 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 23, 20 стр., 14595.RopB protein of Rhizobium leguminosarum bv. viciae adopts amyloid state during symbiotic interactions with pea (Pisum sativum L.)
Косолапова, А. О., Белоусов, М. В., Сулацкий, М. И., Цыганова, А. В., Сулацкая, А. И., Бобылёв, А., Штарк, О. Ю., Цыганов, В. Е., Волков, К. В., Жуков, В. А., Тихонович, И. А. & Нижников, А. А., 24 окт 2022, в: Frontiers in Plant Science. 13, 1014699.Isolation and Characterization of 1-Hydroxy-2,6,6-trimethyl-4-oxo-2-cyclohexene-1-acetic Acid, a Metabolite in Bacterial Transformation of Abscisic Acid
Юзихин, О. С., Шапошников, А. И., Коннова, Т. А., Сырова, Д. С., Hamo, H., Ермеккалиев, Т. С., Шевченко, В. П., Шевченко, К. В., Гоголева, Н. Е., Нижников, А. А., Сафронова, В. И., Камнев, А. А., Белимов, А. А. & Гоголев, Ю. В., 18 окт 2022, в: Biomolecules. 12, 10, 1508.Current Methods for Recombination Detection in Bacteria
Shikov, A. E., Malovichko, Y. V., Nizhnikov, A. A. & Antonets, K. S., 1 июн 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 11, 6257.Genomic characterization of two Salmonella entericasubsp. enterica var. Issatschenko strains possessing selective rodenticidal properties
Malovichko, Y. V., Shikov, A. E., Belousova, M. E., Merkushova, A. V., Nizhnikov, A. A. & Antonets, K. S., 1 мая 2022, в: FASEB Journal. 36, S1К юбилею выдающегося селекционера, вице-президента ВОГиС, академика РАН Людмилы Андреевны Беспаловой
Нижников, А. А., Хлесткина, Е. К. & Тихонович, И. А., 12 апр 2022, в: Биотехнология и селекция растений. 5, 1, стр. 42-46 5 стр.Биоинформатика прирастает Cибирью: К юбилею академика РАН Николая Александровича Колчанова
Хлесткина, Е. К., Нижников, А. А. & Тихонович, И. А., 5 апр 2022, в: Биотехнология и селекция растений. 5, 1, стр. 47-51 5 стр.β-Barrels and Amyloids: Structural Transitions, Biological Functions, and Pathogenesis
Сулацкая, А. И., Косолапова, А. О., Бобылёв, А., Белоусов, М. В., Антонец, К. С., Сулацкий, М. И., Кузнецова, И., Туроверов, К., Степаненко, О. В. & Нижников, А. А., 1 ноя 2021, в: International Journal of Molecular Sciences. 22, 21, 27 стр., 11316.Temporal control of seed development in dicots: Molecular bases, ecological impact and possible evolutionary ramifications
Malovichko, Y. V., Shikov, A. E., Nizhnikov, A. A. & Antonets, K. S., 1 сен 2021, в: International Journal of Molecular Sciences. 22, 17, 9252.Dissecting the environmental consequences of bacillus thuringiensis application for natural ecosystems
Belousova, M. E., Malovichko, Y. V., Shikov, A. E., Nizhnikov, A. A. & Antonets, K. S., мая 2021, в: Toxins. 13, 5, 355.The distribution of several genomic virulence determinants does not corroborate the established serotyping classification of bacillus thuringiensis
Shikov, A. E., Malovichko, Y. V., Lobov, A. A., Belousova, M. E., Nizhnikov, A. A. & Antonets, K. S., 1 мар 2021, в: International Journal of Molecular Sciences. 22, 5, стр. 1-24 24 стр., 2244.Fast and simple approach for production of antibacterial nanocellulose/cuprous oxide hybrid films
Evdokimova, O. L., Belousova, M. E., Evdokimova, A. V., Kusova, T. V., Baranchikov, A. E., Antonets, K. S., Nizhnikov, A. A. & Agafonov, A. V., мар 2021, в: Cellulose. 28, 5, стр. 2931-2945 15 стр.Rhizosphere bacterium rhodococcus sp. P1y metabolizes ab-scisic acid to form dehydrovomifoliol
Yuzikhin, O. S., Gogoleva, N. E., Shaposhnikov, A. I., Konnova, T. A., Osipova, E. V., Syrova, D. S., Ermakova, E. A., Shevchenko, V. P., Nagaev, I. Y., Shevchenko, K. V., Myasoedov, N. F., Safronova, V. I., Shavarda, A. L., Nizhnikov, A. A., Belimov, A. A. & Gogolev, Y. V., мар 2021, в: Biomolecules. 11, 3, стр. 1-16 16 стр., 345.Biological Functions of Prokaryotic Amyloids in Interspecies Interactions: Facts and Assumptions
Kosolapova, A. O., Antonets, K. S., Belousov, M. V. & Nizhnikov, A. A., 1 окт 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 19, стр. 1-26 26 стр., 7240.Accumulation of storage proteins in plant seeds is mediated by amyloid formation
Антонец, К. С., Белоусов, М. В., Сулацкая, А., Белоусова, М., Косолапова, А. О., Сулацкий, М., Андреева, Е. А., Зыкин, П. А., Маловичко, Ю. В., Штарк, О. Ю., Лыхолай, А. Н., Волков, К. В., Кузнецова, И., Туроверов, К., Кочеткова, Е. Ю., Бобылёв, А., Усачёв, К., Демидов, О., Тихонович, И. А. & Нижников, А. А., 23 июл 2020, в: PLoS Biology. 18, 7, 32 стр., e3000564.Transcriptomic Insights into Mechanisms of Early Seed Maturation in the Garden Pea (Pisum sativum L.)
Маловичко, Ю. В., Штарк, О. Ю., Васильева, Е. Н., Нижников, А. А. & Антонец, К. С., 23 мар 2020, в: Cells. 9, 3, 32 стр., 779.No More Tears: Mining Sequencing Data for Novel Bt Cry Toxins with CryProcessor
Шиков, А. Е., Маловичко, Ю. В., Скитченко, Р., Нижников, А. А. & Антонец, К. С., мар 2020, в: Toxins. 12, 3, 8 стр., 204.RNA-binding protein FXR1 is presented in rat brain in amyloid form
Sopova, J. V., Koshel, E. I., Belashova, T. A., Zadorsky, S. P., Sergeeva, A. V., Siniukova, V. A., Shenfeld, A. A., Velizhanina, M. E., Volkov, K. V., Nizhnikov, A. A., Kachkin, D. V., Gaginskaya, E. R. & Galkin, A. P., 1 дек 2019, в: Scientific Reports. 9, 1, 18983.Two Novel Amyloid Proteins, RopA and RopB, from the Root Nodule Bacterium Rhizobium leguminosarum
Kosolapova, A. O., Belousov, M. V., Sulatskaya, A. I., Belousova, M. E., Sulatsky, M. I., Antonets, K. S., Volkov, K. V., Lykholay, A. N., Shtark, O. Y., Vasileva, E. N., Zhukov, V. A., Ivanova, A. N., Zykin, P. A., Kuznetsova, I. M., Turoverov, K. K., Tikhonovich, I. A. & Nizhnikov, A. A., 4 ноя 2019, в: Biomolecules. 9, 11, 24 стр., 694.Repertoire of the Bacillus thuringiensis Virulence Factors Unrelated to Major Classes of Protein Toxins and Its Role in Specificity of Host-Pathogen Interactions
Malovichko, Y. V., Nizhnikov, A. A. & Antonets, K. S., 17 июн 2019, в: Toxins. 11, 6, 18 стр., 347.The Gln3 transcriptional regulator of Saccharomyces cerevisiae manifests prion-like properties upon overproduction
Antonets, K. S., Belousov, M. V., Belousova, Ь. & Nizhnikov, A. A., 1 апр 2019, в: Biochemistry (Moscow). 84, 4, стр. 441-451Транскрипционный регулятор Gln3 Saccharomyces cerevisiae демонстрирует прионоподобные свойства при сверхпродукции
Антонец, К. С., Белоусов, М. В., Белоусова, М. Е. & Нижников, А. А., 29 мар 2019, в: БИОХИМИЯ. 84, 4, стр. 587-599RNA Sequencing Reveals Specific Transcriptomic Signatures Distinguishing Effects of the [SWI+] Prion and SWI1 Deletion in Yeast Saccharomyces cerevisiae
Malovichko, Y. V., Antonets, K. S., Maslova, A. R., Andreeva, E. A., Inge-Vechtomov, S. G. & Nizhnikov, A. A., мар 2019, в: Genes. 10, 3, 212.Proteomic Profile of the Bacterium Sinorhizobium meliloti Depends on Its Life Form and Host Plant Species
Antonets, K. S., Onishchuk, O. P., Kurchak, O. N., Volkov, K. V., Lykholay, A. N., Andreeva, E. A., Andronov, E. E., Pinaev, A. G., Provorov, N. A. & Nizhnikov, A. A., 1 сен 2018, в: Molecular Biology. 52, 5, стр. 779-785 7 стр.ПРОТЕОМНЫЙ ПРОФИЛЬ БАКТЕРИИ Sinorhizobium meliloti ЗАВИСИТ ОТ ЕЕ ЖИЗНЕННОЙ ФОРМЫ И ВИДА РАСТЕНИЯ-ХОЗЯИНА
Antonets, K. S., Onishchuk, O. P., Kurchak, O. N., Volkov, K. V., Lykholay, A. N., Andreeva, E. A., Andronov, E. E., Pinaev, A. G., Provorov, N. A. & Nizhnikov, A. A., 1 сен 2018, в: Molekuliarnaia biologiia. 52, 5, стр. 898-904 7 стр.Protein co-aggregation related to amyloids: Methods of investigation, diversity, and classification
Bondarev, S. A., Antonets, K. S., Kajava, A. V., Nizhnikov, A. A. & Zhouravleva, G. A., 4 авг 2018, в: International Journal of Molecular Sciences. 19, 8, 30 стр., 2292.Screening for amyloid proteins in the yeast proteome
Ryzhova, T., Sopova, J. V., Zadorsky, S. P., Siniukova, V. A., Sergeeva, A. V., Galkina, S. A., Nizhnikov, A. A., Shenfeld, A. A., Volkov, K. V. & Galkin, A. P., 1 апр 2018, в: Current Genetics. 64, 2, стр. 469-478 10 стр.Exploring proteins containing amyloidogenic regions in the proteomes of bacteria of the order Rhizobiales
Antonets, K. S., Kliver, S. F. & Nizhnikov, A. A., 1 янв 2018, в: Evolutionary Bioinformatics. 14, стр. 1-12 12 стр.M60-like metalloprotease domain of the Escherichia coli YghJ protein forms amyloid fibrils
Belousov, M. V., Bondarev, S. A., Kosolapova, A. O., Antonets, K. S., Sulatskaya, A. I., Sulatsky, M. I., Zhouravleva, G. A., Kuznetsova, I. M., Turoverov, K. K. & Nizhnikov, A. A., 2018, в: PLoS ONE. 13, 1, стр. e0191317 17 стр., e0191317.Штамм Bacillus thuringiensis var. darmstadiensis 56 в качестве полифункционального средства для растениеводства.
Тихонович, И. А., Ермолова, В. П., Гришечкина, С. Д., Романова, Т. А., Нижников, А. А. & Антонец, К. С., 11 дек 2017, Патент № RU 2692655Predicting amyloidogenic proteins in the proteomes of plants
Antonets, K. S. & Nizhnikov, A. A., 16 окт 2017, в: International Journal of Molecular Sciences. 18, 10, 2155.Amyloids and prions in plants: Facts and perspectives
Antonets, K. S. & Nizhnikov, A. A., 3 сен 2017, в: Prion. 11, 5, стр. 300-312 13 стр.Distinct Mechanisms of Phenotypic Effects of Inactivation and Prionization of Swi1 Protein in Saccharomyces cerevisiae
Antonets, K. S., Kliver, S. F., Polev, D. E., Shuvalova, A. R., Andreeva, E. A., Inge-Vechtomov, S. G. & Nizhnikov, A. A., 2017, в: Biochemistry (Moscow). 82, 10, стр. 1147-1157 11 стр.Proteomic analysis of Escherichia coli protein fractions resistant to solubilization by ionic detergents
Антонец, К. С., Волков, К. В., Мальцева, А. Л., Аршакян, Л. М., Галкин, А. П. & Нижников, А. А., янв 2016, в: Biochemistry (Moscow). 81, 1, стр. 34-36A glutamine/asparagine-rich fragment of Gln3, but not the full-length protein, aggregates in Saccharomyces cerevisiae
Antonets, K. S., Sargsyan, H. M. & Nizhnikov, A. A., 2016, в: Biochemistry (Moscow). 81, 4, стр. 407-413Interaction of prions causes heritable traits in Saccharomyces cerevisiae
Nizhnikov, A. A., Ryzhova, T. A., Volkov, K. V., Zadorsky, S. P., Sopova, J. V., Inge-Vechtomov, S. G. & Galkin, A. P., 2016, в: PLoS Genetics. 12, 12, doi: 10.1371/journal.pgen.1006504.Prions, amyloids, and RNA: Pieces of a puzzle
Nizhnikov, A. A., Antonets, K. S., Bondarev, S. A., Inge-Vechtomov, S. G. & Derkatch, I. L., 2016, в: Prion. 10, 3, стр. 182-206SFP1-mediated prion-dependent lethality is caused by increased Sup35 aggregation and alleviated by Sis1
Matveenko, A. G., Drozdova, P. B., Belousov, M. V., Moskalenko, S. E., Bondarev, S. A., Barbitoff, Y. A., Nizhnikov, A. A. & Zhouravleva, G. A., 2016, в: Genes to Cells. 21, 12, стр. 1290-1308 19 стр.Amyloids: from Pathogenesis to Function
Nizhnikov, A. A., Antonets, K. S. & Inge-Vechtomov, S. G., 2015, в: Biochemistry (Moscow). 80, 9, стр. 1127-1144 18 стр.Modulation of efficiency of translation termination in Saccharomyces cerevisiae: Turning nonsense into sense
Nizhnikov, A. A., Antonets, K. S., Inge-Vechtomov, S. G. & Derkatch, I. L., 2014, в: Prion. 8, 3, стр. 247-260 14 стр.Overexpression of genes encoding asparagine-glutamine-rich transcriptional factors causes nonsense suppression in Saccharomyces cerevisiae
Nizhnikov, A. A., Kondrashkina, A. M., Antonets, K. S. & Galkin, A. P., 2014, в: Russian Journal of Genetics: Applied Research. 4, 2, стр. 122-130Prion-like determinant [NSI +] decreases the expression of the SUP45 gene in Saccharomyces cerevisiae
Kondrashkina, A. M., Antonets, K. S., Galkin, A. P. & Nizhnikov, A. A., 2014, в: Molecular Biology. 48, 5, стр. 688-693Proteomic screening for amyloid proteins
Nizhnikov, A. A., Alexandrov, A. I., Ryzhova, T. A., Mitkevich, O. V., Dergalev, A. A., Ter-Avanesyan, M. D. & Galkin, A. P., 2014, в: PLoS ONE. 9, 12, e116003.Прионоподобный детерминант [NSI+] Saccharomyces cerevisiae снижает экспрессию гена SUP45
Кондрашкина, А. М., Антонец, К. С., Галкин, А. П. & Нижников, А. А., 2014, в: МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ. 48, 5, стр. 790-796 7 стр.Interactions of [NSI +] prion-like determinant with SUP35 and VTS1 genes in Saccharomyces cerevisiae
Nizhnikov, A. A., Kondrashkina, A. M. & Galkin, A. P., 2013, в: Russian Journal of Genetics. 49, 10, стр. 1004-1012SARP: A Novel Algorithm to Assess Compositional Biases in Protein Sequences
Antonets, K. S. & Nizhnikov, A. A., 2013, в: Evolutionary Bioinformatics. 9, стр. 263-273 11 стр.Взаимодействие прионоподобного детерминанта [NSI+] дрожжей Saccharomyces cerevisiae с генами SUP35 и VTS1
Нижников, А. А., Кондрашкина, А. М. & Галкин, А. П., 2013, в: ГЕНЕТИКА. 49, 10, стр. 1155-1164 10 стр.Сверхэкспрессия генов, кодирующих аспарагин-глутамин обогащенные транскрипционные факторы, вызывает нонсенс-супрессию у дрожжей Saccharomyces cerevisiae
Нижников, А. А., Кондрашкина, А. М., Антонец, К. С. & Галкин, А. П., 2013, в: ЭКОЛОГИЧЕСКАЯ ГЕНЕТИКА. 11, 1, стр. 49-58Identification of Genes Encoding Potentially Amyloidogenic Proteins that Take Part in the Regulation of Nonsense Suppression in Yeast Saccharomyces cerevisiae
Nizhnikov, A. A., Magomedova, Z. M., Saifitdinova, A. F., Inge-Vechtomov, S. G. & Galkin, A. P., 2012, в: Russian Journal of Genetics: Applied Research. 2, 5, стр. 398-404[NSI+] determinant has a pleiotropic phenotypic manifestation that is modulated by SUP35, SUP45, and VTS1 genes
Nizhnikov, AA., Magomedova, ZM., Rubel, AA., Kondrashkina, AM., Inge-Vechtomov, SG. & Galkin, AP., 2012, в: Current Genetics. 58, 1, стр. 35-47Выявление генов, кодирующих потенциально амилоидогенные белки, участвующих в регуляции нонсенс-супрессии у дрожжей Saccharomyces cerevisiae
Нижников, А. А., Магомедова, З. М., Сайфитдинова, А. Ф., Инге-Вечтомов, С. Г. & Галкин, А. П., 2011, в: ЭКОЛОГИЧЕСКАЯ ГЕНЕТИКА. 9, 4, стр. 79-86[NSI+], a novel non-Mendelian nonsense suppressor determinant in Saccharomyces cerevisiae
Saifitdinova, A. F., Nizhnikov, A. A., Lada, A. G., Rubel, A. A., Magomedova, Z. M., Ignatova, V. V., Inge-Vechtomov, S. G. & Galkin, A. P., 2010, в: Current Genetics. 56, 5, стр. 467-478Yeast chaperone Hspl04 regulates gene expression on the posttranscriptional level
Rubel', A. A., Saǐfitdinova, A. F., Lada, A. G., Nizhnikov, A. A., Inge-Vechtomov, S. G. & Galkin, A. P., 1 янв 2008, в: Molekuliarnaia biologiia. 42, 1, стр. 123-130 8 стр.Yeast Chaperone Hsp104 Controls Gene Expression at the Posttranscriptional Level
Rubel, A. A., Saifitdinova, A. F., Lada, A. G., Nizhnikov, A. A., Inge-Vechtomov, S. G. & Galkin, A. P., 2008, в: Molecular Biology. 42, 1, стр. 110-116Дрожжевой шаперон Hsp104 регулирует экспрессию генов на посттранскрипционном уровне
Рубель, А. А., Сайфитдинова, А. Ф., Лада, А. Г., Нижников, А. А., Инге-Вечтомов, С. Г. & Галкин, А. П., 2008, в: МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ. 42, 1, стр. 123-130
