Prof. Dr. Anton A. Nizhnikov,
Head of Department of Genetics and Biotechnology
Cupin-1.1 Adsorption Layers at the Surface of 8 M Urea Solutions
Исаков, Н. А., Белоусов, М. В., Loglio, G., Миллер, Р., Нижников, А. А., Panda, A. K. & Носков, Б. А., 5 Dec 2024, In: Journal of Physical Chemistry B. 128, 48Pathogenesis-associated bacterial amyloids: the network of interactions
Фаюд, Х., Белоусов, М. В., Антонец, К. С. & Нижников, А. А., 1 Dec 2024, In: Biochemistry (Moscow). 89, 12-13, p. 2107-2132Genomic Insights into the Bactericidal and Fungicidal Potential of Bacillus mycoides b12.3 Isolated in the Soil of Olkhon Island in Lake Baikal, Russia
Романенко, М. Н., Шиков, А. Е., Савина, Ю., Шматов, Ф., Нижников, А. А. & Антонец, К. С., 28 Nov 2024, In: Microorganisms. 12, 12, 2450.Whole-Genome Sequencing of Peribacillus frigoritolerans Strain d21.2 Isolated in the Republic of Dagestan, Russia
Романенко, М. Н., Шиков, А. Е., Савина, Ю. А., Нижников, А. А. & Антонец, К. С., 24 Nov 2024, In: Microorganisms. 12, 12, 2410.A new Peribacillus simplex d27.3 strain mediates antimicrobial activity through a combination of secondary metabolites, including fengycins
Baranova, M., Romanenko, M., Savina, I., Pilipenko, E., Belozerova, O., Terekhov, S., Nizhnikov, A., Antonets, K. & Smirnov, I., 10 Oct 2024, In: Biological Communications. 69, 2, p. 111-116 6 p.Dynamic properties of the layers of cupin-1.1 aggregates at the air/water interface
Исаков, Н. А., Белоусов, М. В., Нижников, А. А. & Носков, Б. А., 1 Apr 2024, In: Biophysical Chemistry. 307, 7 p., 107166.Draft Genome Sequencing of the Bacillus thuringiensis var. Thuringiensis Highly Insecticidal Strain 800/15
Шиков, А. Е., Савина, Ю. А., Романенко, М. Н., Нижников, А. А. & Антонец, К. С., 10 Feb 2024, In: Data. 9, 2, 34.Genetic Collections of St. Petersburg University
Андреева, Е. А., Бурлаковский, М. С., Бузовкина, И. С., Чекунова, Е. М., Додуева, И. Е., Голубкова, Е. В., Матвеенко, А. Г., Румянцев, А. М., Цветкова, Н. В., Задорский, С. П. & Нижников, А. А., 30 Nov 2023, In: Biological Communications. 68, 3, p. 199-214 15 p.Draft Genome Sequence Data of Lysinibacillus sphaericus Strain 1795 with Insecticidal Properties
Романенко, М. Н., Нестеренко, М. А., Шиков, А. Е., Нижников, А. А. & Антонец, К. С., 3 Nov 2023, In: Data. 8, 11, 167.OmpC and OmpF Outer Membrane Proteins of Escherichia coli and Salmonella enterica Form Bona Fide Amyloids
Белоусов, М. В., Косолапова, А. О., Фаюд, Х., Сулацкий, М. И., Сулацкая, А. И., Романенко, М. Н., Бобылёв, А. Г., Антонец, К. С. & Нижников, А. А., 24 Oct 2023, In: International Journal of Molecular Sciences. 24, 21, 22 p., 15522.Прионы и амилоиды как пространственные матрицы протеома
Инге-Вечтомов, С. Г., Галкин, А. П., Журавлева, Г. А., Нижников, А. А. & Задорский, С. П., 15 Sep 2023, In: ВЕСТНИК РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК. 93, 9, p. 845-854 10 p.Recombination in Bacterial Genomes: Evolutionary Trends
Шиков, А. Е., Савина, Ю. А., Нижников, А. А. & Антонец, К. С., 12 Sep 2023, In: Toxins. 15, 9, 568.The man, the plant, and the insect: shooting host specificity determinants in Serratia marcescens pangenome
Шиков, А. Е., Меркушова, А. В., Савина, Ю. А., Нижников, А. А. & Антонец, К. С., 12 Sep 2023, In: Frontiers in Microbiology. 14, 1211999.For Someone, You Are the Whole World: Host-Specificity of Salmonella enterica
Меркушова, А. В., Шиков, А. Е., Нижников, А. А. & Антонец, К. С., 5 Sep 2023, In: International Journal of Molecular Sciences. 24, 18, 13670.Amyloid Fibrils of Pisum sativum L. Vicilin Inhibit Pathological Aggregation of Mammalian Proteins
Сулацкий, М. И., Белоусов, М. В., Косолапова, А. О., Михайлова, Е., Романенко, М. Н., Антонец, К. С., Кузнецова, И. М., Туроверов, К., Нижников, А. А. & Сулацкая, А. И., 18 Aug 2023, In: International Journal of Molecular Sciences. 24, 16, 21 p., 12932.Overview of the Special Issue “Protein-Based Infection, Inheritance, and Memory”
Чернов, Ю. О. & Нижников, А. А., 10 Jul 2023, In: International Journal of Molecular Sciences. 24, 14, 11280.Salmonella-Based Biorodenticides: Past Applications and Current Contradictions
Shikov, A. E., Belousova, M. E., Belousov, M. V., Nizhnikov, A. A. & Antonets, K. S., Dec 2022, In: International Journal of Molecular Sciences. 23, 23, 20 p., 14595.RopB protein of Rhizobium leguminosarum bv. viciae adopts amyloid state during symbiotic interactions with pea (Pisum sativum L.)
Косолапова, А. О., Белоусов, М. В., Сулацкий, М. И., Цыганова, А. В., Сулацкая, А. И., Бобылёв, А., Штарк, О. Ю., Цыганов, В. Е., Волков, К. В., Жуков, В. А., Тихонович, И. А. & Нижников, А. А., 24 Oct 2022, In: Frontiers in Plant Science. 13, 1014699.Isolation and Characterization of 1-Hydroxy-2,6,6-trimethyl-4-oxo-2-cyclohexene-1-acetic Acid, a Metabolite in Bacterial Transformation of Abscisic Acid
Юзихин, О. С., Шапошников, А. И., Коннова, Т. А., Сырова, Д. С., Hamo, H., Ермеккалиев, Т. С., Шевченко, В. П., Шевченко, К. В., Гоголева, Н. Е., Нижников, А. А., Сафронова, В. И., Камнев, А. А., Белимов, А. А. & Гоголев, Ю. В., 18 Oct 2022, In: Biomolecules. 12, 10, 1508.Current Methods for Recombination Detection in Bacteria
Shikov, A. E., Malovichko, Y. V., Nizhnikov, A. A. & Antonets, K. S., 1 Jun 2022, In: International Journal of Molecular Sciences. 23, 11, 6257.Genomic characterization of two Salmonella entericasubsp. enterica var. Issatschenko strains possessing selective rodenticidal properties
Malovichko, Y. V., Shikov, A. E., Belousova, M. E., Merkushova, A. V., Nizhnikov, A. A. & Antonets, K. S., 1 May 2022, In: FASEB Journal. 36, S1К юбилею выдающегося селекционера, вице-президента ВОГиС, академика РАН Людмилы Андреевны Беспаловой
Нижников, А. А., Хлесткина, Е. К. & Тихонович, И. А., 12 Apr 2022, In: Биотехнология и селекция растений. 5, 1, p. 42-46 5 p.Биоинформатика прирастает Cибирью: К юбилею академика РАН Николая Александровича Колчанова
Хлесткина, Е. К., Нижников, А. А. & Тихонович, И. А., 5 Apr 2022, In: Биотехнология и селекция растений. 5, 1, p. 47-51 5 p.β-Barrels and Amyloids: Structural Transitions, Biological Functions, and Pathogenesis
Сулацкая, А. И., Косолапова, А. О., Бобылёв, А., Белоусов, М. В., Антонец, К. С., Сулацкий, М. И., Кузнецова, И., Туроверов, К., Степаненко, О. В. & Нижников, А. А., 1 Nov 2021, In: International Journal of Molecular Sciences. 22, 21, 27 p., 11316.Temporal control of seed development in dicots: Molecular bases, ecological impact and possible evolutionary ramifications
Malovichko, Y. V., Shikov, A. E., Nizhnikov, A. A. & Antonets, K. S., 1 Sep 2021, In: International Journal of Molecular Sciences. 22, 17, 9252.Dissecting the environmental consequences of bacillus thuringiensis application for natural ecosystems
Belousova, M. E., Malovichko, Y. V., Shikov, A. E., Nizhnikov, A. A. & Antonets, K. S., May 2021, In: Toxins. 13, 5, 355.The distribution of several genomic virulence determinants does not corroborate the established serotyping classification of bacillus thuringiensis
Shikov, A. E., Malovichko, Y. V., Lobov, A. A., Belousova, M. E., Nizhnikov, A. A. & Antonets, K. S., 1 Mar 2021, In: International Journal of Molecular Sciences. 22, 5, p. 1-24 24 p., 2244.Fast and simple approach for production of antibacterial nanocellulose/cuprous oxide hybrid films
Evdokimova, O. L., Belousova, M. E., Evdokimova, A. V., Kusova, T. V., Baranchikov, A. E., Antonets, K. S., Nizhnikov, A. A. & Agafonov, A. V., Mar 2021, In: Cellulose. 28, 5, p. 2931-2945 15 p.Rhizosphere bacterium rhodococcus sp. P1y metabolizes ab-scisic acid to form dehydrovomifoliol
Yuzikhin, O. S., Gogoleva, N. E., Shaposhnikov, A. I., Konnova, T. A., Osipova, E. V., Syrova, D. S., Ermakova, E. A., Shevchenko, V. P., Nagaev, I. Y., Shevchenko, K. V., Myasoedov, N. F., Safronova, V. I., Shavarda, A. L., Nizhnikov, A. A., Belimov, A. A. & Gogolev, Y. V., Mar 2021, In: Biomolecules. 11, 3, p. 1-16 16 p., 345.Biological Functions of Prokaryotic Amyloids in Interspecies Interactions: Facts and Assumptions
Kosolapova, A. O., Antonets, K. S., Belousov, M. V. & Nizhnikov, A. A., 1 Oct 2020, In: International Journal of Molecular Sciences. 21, 19, p. 1-26 26 p., 7240.Accumulation of storage proteins in plant seeds is mediated by amyloid formation
Антонец, К. С., Белоусов, М. В., Сулацкая, А., Белоусова, М., Косолапова, А. О., Сулацкий, М., Андреева, Е. А., Зыкин, П. А., Маловичко, Ю. В., Штарк, О. Ю., Лыхолай, А. Н., Волков, К. В., Кузнецова, И., Туроверов, К., Кочеткова, Е. Ю., Бобылёв, А., Усачёв, К., Демидов, О., Тихонович, И. А. & Нижников, А. А., 23 Jul 2020, In: PLoS Biology. 18, 7, 32 p., e3000564.Transcriptomic Insights into Mechanisms of Early Seed Maturation in the Garden Pea (Pisum sativum L.)
Маловичко, Ю. В., Штарк, О. Ю., Васильева, Е. Н., Нижников, А. А. & Антонец, К. С., 23 Mar 2020, In: Cells. 9, 3, 32 p., 779.No More Tears: Mining Sequencing Data for Novel Bt Cry Toxins with CryProcessor
Шиков, А. Е., Маловичко, Ю. В., Скитченко, Р., Нижников, А. А. & Антонец, К. С., Mar 2020, In: Toxins. 12, 3, 8 p., 204.RNA-binding protein FXR1 is presented in rat brain in amyloid form
Sopova, J. V., Koshel, E. I., Belashova, T. A., Zadorsky, S. P., Sergeeva, A. V., Siniukova, V. A., Shenfeld, A. A., Velizhanina, M. E., Volkov, K. V., Nizhnikov, A. A., Kachkin, D. V., Gaginskaya, E. R. & Galkin, A. P., 1 Dec 2019, In: Scientific Reports. 9, 1, 18983.Two Novel Amyloid Proteins, RopA and RopB, from the Root Nodule Bacterium Rhizobium leguminosarum
Kosolapova, A. O., Belousov, M. V., Sulatskaya, A. I., Belousova, M. E., Sulatsky, M. I., Antonets, K. S., Volkov, K. V., Lykholay, A. N., Shtark, O. Y., Vasileva, E. N., Zhukov, V. A., Ivanova, A. N., Zykin, P. A., Kuznetsova, I. M., Turoverov, K. K., Tikhonovich, I. A. & Nizhnikov, A. A., 4 Nov 2019, In: Biomolecules. 9, 11, 24 p., 694.Repertoire of the Bacillus thuringiensis Virulence Factors Unrelated to Major Classes of Protein Toxins and Its Role in Specificity of Host-Pathogen Interactions
Malovichko, Y. V., Nizhnikov, A. A. & Antonets, K. S., 17 Jun 2019, In: Toxins. 11, 6, 18 p., 347.The Gln3 transcriptional regulator of Saccharomyces cerevisiae manifests prion-like properties upon overproduction
Antonets, K. S., Belousov, M. V., Belousova, Ь. & Nizhnikov, A. A., 1 Apr 2019, In: Biochemistry (Moscow). 84, 4, p. 441-451Транскрипционный регулятор Gln3 Saccharomyces cerevisiae демонстрирует прионоподобные свойства при сверхпродукции
Антонец, К. С., Белоусов, М. В., Белоусова, М. Е. & Нижников, А. А., 29 Mar 2019, In: БИОХИМИЯ. 84, 4, p. 587-599RNA Sequencing Reveals Specific Transcriptomic Signatures Distinguishing Effects of the [SWI+] Prion and SWI1 Deletion in Yeast Saccharomyces cerevisiae
Malovichko, Y. V., Antonets, K. S., Maslova, A. R., Andreeva, E. A., Inge-Vechtomov, S. G. & Nizhnikov, A. A., Mar 2019, In: Genes. 10, 3, 212.Proteomic Profile of the Bacterium Sinorhizobium meliloti Depends on Its Life Form and Host Plant Species
Antonets, K. S., Onishchuk, O. P., Kurchak, O. N., Volkov, K. V., Lykholay, A. N., Andreeva, E. A., Andronov, E. E., Pinaev, A. G., Provorov, N. A. & Nizhnikov, A. A., 1 Sep 2018, In: Molecular Biology. 52, 5, p. 779-785 7 p.ПРОТЕОМНЫЙ ПРОФИЛЬ БАКТЕРИИ Sinorhizobium meliloti ЗАВИСИТ ОТ ЕЕ ЖИЗНЕННОЙ ФОРМЫ И ВИДА РАСТЕНИЯ-ХОЗЯИНА
Antonets, K. S., Onishchuk, O. P., Kurchak, O. N., Volkov, K. V., Lykholay, A. N., Andreeva, E. A., Andronov, E. E., Pinaev, A. G., Provorov, N. A. & Nizhnikov, A. A., 1 Sep 2018, In: Molekuliarnaia biologiia. 52, 5, p. 898-904 7 p.Protein co-aggregation related to amyloids: Methods of investigation, diversity, and classification
Bondarev, S. A., Antonets, K. S., Kajava, A. V., Nizhnikov, A. A. & Zhouravleva, G. A., 4 Aug 2018, In: International Journal of Molecular Sciences. 19, 8, 30 p., 2292.Screening for amyloid proteins in the yeast proteome
Ryzhova, T., Sopova, J. V., Zadorsky, S. P., Siniukova, V. A., Sergeeva, A. V., Galkina, S. A., Nizhnikov, A. A., Shenfeld, A. A., Volkov, K. V. & Galkin, A. P., 1 Apr 2018, In: Current Genetics. 64, 2, p. 469-478 10 p.Exploring proteins containing amyloidogenic regions in the proteomes of bacteria of the order Rhizobiales
Antonets, K. S., Kliver, S. F. & Nizhnikov, A. A., 1 Jan 2018, In: Evolutionary Bioinformatics. 14, p. 1-12 12 p.M60-like metalloprotease domain of the Escherichia coli YghJ protein forms amyloid fibrils
Belousov, M. V., Bondarev, S. A., Kosolapova, A. O., Antonets, K. S., Sulatskaya, A. I., Sulatsky, M. I., Zhouravleva, G. A., Kuznetsova, I. M., Turoverov, K. K. & Nizhnikov, A. A., 2018, In: PLoS ONE. 13, 1, p. e0191317 17 p., e0191317.Штамм Bacillus thuringiensis var. darmstadiensis 56 в качестве полифункционального средства для растениеводства.
Тихонович, И. А., Ермолова, В. П., Гришечкина, С. Д., Романова, Т. А., Нижников, А. А. & Антонец, К. С., 11 Dec 2017, Patent No. RU 2692655Predicting amyloidogenic proteins in the proteomes of plants
Antonets, K. S. & Nizhnikov, A. A., 16 Oct 2017, In: International Journal of Molecular Sciences. 18, 10, 2155.Amyloids and prions in plants: Facts and perspectives
Antonets, K. S. & Nizhnikov, A. A., 3 Sep 2017, In: Prion. 11, 5, p. 300-312 13 p.Distinct Mechanisms of Phenotypic Effects of Inactivation and Prionization of Swi1 Protein in Saccharomyces cerevisiae
Antonets, K. S., Kliver, S. F., Polev, D. E., Shuvalova, A. R., Andreeva, E. A., Inge-Vechtomov, S. G. & Nizhnikov, A. A., 2017, In: Biochemistry (Moscow). 82, 10, p. 1147-1157 11 p.Proteomic analysis of Escherichia coli protein fractions resistant to solubilization by ionic detergents
Антонец, К. С., Волков, К. В., Мальцева, А. Л., Аршакян, Л. М., Галкин, А. П. & Нижников, А. А., Jan 2016, In: Biochemistry (Moscow). 81, 1, p. 34-36A glutamine/asparagine-rich fragment of Gln3, but not the full-length protein, aggregates in Saccharomyces cerevisiae
Antonets, K. S., Sargsyan, H. M. & Nizhnikov, A. A., 2016, In: Biochemistry (Moscow). 81, 4, p. 407-413Interaction of prions causes heritable traits in Saccharomyces cerevisiae
Nizhnikov, A. A., Ryzhova, T. A., Volkov, K. V., Zadorsky, S. P., Sopova, J. V., Inge-Vechtomov, S. G. & Galkin, A. P., 2016, In: PLoS Genetics. 12, 12, doi: 10.1371/journal.pgen.1006504.Prions, amyloids, and RNA: Pieces of a puzzle
Nizhnikov, A. A., Antonets, K. S., Bondarev, S. A., Inge-Vechtomov, S. G. & Derkatch, I. L., 2016, In: Prion. 10, 3, p. 182-206SFP1-mediated prion-dependent lethality is caused by increased Sup35 aggregation and alleviated by Sis1
Matveenko, A. G., Drozdova, P. B., Belousov, M. V., Moskalenko, S. E., Bondarev, S. A., Barbitoff, Y. A., Nizhnikov, A. A. & Zhouravleva, G. A., 2016, In: Genes to Cells. 21, 12, p. 1290-1308 19 p.Amyloids: from Pathogenesis to Function
Nizhnikov, A. A., Antonets, K. S. & Inge-Vechtomov, S. G., 2015, In: Biochemistry (Moscow). 80, 9, p. 1127-1144 18 p.Modulation of efficiency of translation termination in Saccharomyces cerevisiae: Turning nonsense into sense
Nizhnikov, A. A., Antonets, K. S., Inge-Vechtomov, S. G. & Derkatch, I. L., 2014, In: Prion. 8, 3, p. 247-260 14 p.Overexpression of genes encoding asparagine-glutamine-rich transcriptional factors causes nonsense suppression in Saccharomyces cerevisiae
Nizhnikov, A. A., Kondrashkina, A. M., Antonets, K. S. & Galkin, A. P., 2014, In: Russian Journal of Genetics: Applied Research. 4, 2, p. 122-130Prion-like determinant [NSI +] decreases the expression of the SUP45 gene in Saccharomyces cerevisiae
Kondrashkina, A. M., Antonets, K. S., Galkin, A. P. & Nizhnikov, A. A., 2014, In: Molecular Biology. 48, 5, p. 688-693Proteomic screening for amyloid proteins
Nizhnikov, A. A., Alexandrov, A. I., Ryzhova, T. A., Mitkevich, O. V., Dergalev, A. A., Ter-Avanesyan, M. D. & Galkin, A. P., 2014, In: PLoS ONE. 9, 12, e116003.Прионоподобный детерминант [NSI+] Saccharomyces cerevisiae снижает экспрессию гена SUP45
Кондрашкина, А. М., Антонец, К. С., Галкин, А. П. & Нижников, А. А., 2014, In: МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ. 48, 5, p. 790-796 7 p.Interactions of [NSI +] prion-like determinant with SUP35 and VTS1 genes in Saccharomyces cerevisiae
Nizhnikov, A. A., Kondrashkina, A. M. & Galkin, A. P., 2013, In: Russian Journal of Genetics. 49, 10, p. 1004-1012SARP: A Novel Algorithm to Assess Compositional Biases in Protein Sequences
Antonets, K. S. & Nizhnikov, A. A., 2013, In: Evolutionary Bioinformatics. 9, p. 263-273 11 p.Взаимодействие прионоподобного детерминанта [NSI+] дрожжей Saccharomyces cerevisiae с генами SUP35 и VTS1
Нижников, А. А., Кондрашкина, А. М. & Галкин, А. П., 2013, In: ГЕНЕТИКА. 49, 10, p. 1155-1164 10 p.Сверхэкспрессия генов, кодирующих аспарагин-глутамин обогащенные транскрипционные факторы, вызывает нонсенс-супрессию у дрожжей Saccharomyces cerevisiae
Нижников, А. А., Кондрашкина, А. М., Антонец, К. С. & Галкин, А. П., 2013, In: ЭКОЛОГИЧЕСКАЯ ГЕНЕТИКА. 11, 1, p. 49-58Identification of Genes Encoding Potentially Amyloidogenic Proteins that Take Part in the Regulation of Nonsense Suppression in Yeast Saccharomyces cerevisiae
Nizhnikov, A. A., Magomedova, Z. M., Saifitdinova, A. F., Inge-Vechtomov, S. G. & Galkin, A. P., 2012, In: Russian Journal of Genetics: Applied Research. 2, 5, p. 398-404[NSI+] determinant has a pleiotropic phenotypic manifestation that is modulated by SUP35, SUP45, and VTS1 genes
Nizhnikov, AA., Magomedova, ZM., Rubel, AA., Kondrashkina, AM., Inge-Vechtomov, SG. & Galkin, AP., 2012, In: Current Genetics. 58, 1, p. 35-47Выявление генов, кодирующих потенциально амилоидогенные белки, участвующих в регуляции нонсенс-супрессии у дрожжей Saccharomyces cerevisiae
Нижников, А. А., Магомедова, З. М., Сайфитдинова, А. Ф., Инге-Вечтомов, С. Г. & Галкин, А. П., 2011, In: ЭКОЛОГИЧЕСКАЯ ГЕНЕТИКА. 9, 4, p. 79-86[NSI+], a novel non-Mendelian nonsense suppressor determinant in Saccharomyces cerevisiae
Saifitdinova, A. F., Nizhnikov, A. A., Lada, A. G., Rubel, A. A., Magomedova, Z. M., Ignatova, V. V., Inge-Vechtomov, S. G. & Galkin, A. P., 2010, In: Current Genetics. 56, 5, p. 467-478Yeast chaperone Hspl04 regulates gene expression on the posttranscriptional level
Rubel', A. A., Saǐfitdinova, A. F., Lada, A. G., Nizhnikov, A. A., Inge-Vechtomov, S. G. & Galkin, A. P., 1 Jan 2008, In: Molekuliarnaia biologiia. 42, 1, p. 123-130 8 p.Yeast Chaperone Hsp104 Controls Gene Expression at the Posttranscriptional Level
Rubel, A. A., Saifitdinova, A. F., Lada, A. G., Nizhnikov, A. A., Inge-Vechtomov, S. G. & Galkin, A. P., 2008, In: Molecular Biology. 42, 1, p. 110-116Дрожжевой шаперон Hsp104 регулирует экспрессию генов на посттранскрипционном уровне
Рубель, А. А., Сайфитдинова, А. Ф., Лада, А. Г., Нижников, А. А., Инге-Вечтомов, С. Г. & Галкин, А. П., 2008, In: МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ. 42, 1, p. 123-130