NPOmix: a machine learning classifier to connect mass spectrometry fragmentation data to biosynthetic gene clusters

Leão, T. F., Wang, M., da Silva, R., Gurevich, A., Bauermeister, A., Gomes, P. W. P., Brejnrod, A., Glukhov, E., Aron, A. T., Louwen, J. J. R., Kim, H. W., Reher, R., Fiore, M. F., van der Hooft, J. J. J., Gerwick, L., Gerwick, W. H., Bandeira, N. & Dorrestein, P. C., 26 ноя 2022, (Электронная публикация перед печатью) в: PNAS Nexus. pgac257.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Fast and accurate mapping of long reads to complete genome assemblies with VerityMap

Bzikadze, A., Mikheenko, A. & Певзнер, П. А., 15 ноя 2022, (Электронная публикация перед печатью) в: Genome Research.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Agricultural Crops Grown in Laboratory Conditions on Chernevaya Taiga Soil Demonstrate Unique Composition of the Rhizosphere Microbiota

Kravchenko, I., Rayko, M., Tikhonova, E., Konopkin, A., Evgeny Abakumov, E. A. & Lapidus, A., 31 окт 2022, в: Microorganisms. 10, 11, 2171.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

MetaGT: A pipeline for de novo assembly of metatranscriptomes with the aid of metagenomic data

Шафранская, Д. Д., Kale, V., Finn, R., Лапидус, А. Л., Коробейников, А. И. & Пржибельский, А. Д., 28 окт 2022, в: Frontiers in Microbiology. 13, 981458.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Varidnaviruses in the Human Gut: A Major Expansion of the Order Vinavirales

Yutin, N., Rayko, M., Antipov, D., Mutz, P., Wolf, Y. I., Krupovic, M. & Koonin, E. V., 23 авг 2022, в: Viruses. 14, 9, 1842.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

BinSPreader: Refine binning results for fuller MAG reconstruction

Tolstoganov, I., Kamenev, Y., Kruglikov, R., Ochkalova, S. & Korobeynikov, A., 19 авг 2022, в: iScience. 25, 8, 104770.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Thecochaos is not a myth: study of the genus Thecochaos (Amoebozoa, Discosea) – a rediscovered group of lobose amoeba, with short SSU gene

Мезенцев, Е. С., Бондаренко, Н. И., Камышацкая, О. Г., Насонова, Е. С., Глотова, А. А., Лойко, С., Истигечев, Г., КУЛЕМЗИНА, А., Абакумов, Е. В., Райко, М. П., Лапидус, А. Л. & Смирнов, А. В., 17 авг 2022, (Электронная публикация перед печатью) в: Organisms Diversity and Evolution.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Multiplex de Bruijn graphs enable genome assembly from long, high-fidelity reads

Bankevich, A., Bzikadze, A. V., Kolmogorov, M., Antipov, D. & Pevzner, P. A., июл 2022, в: Nature Biotechnology. 40, 7, стр. 1075-1081 7 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Single-nuclei isoform RNA sequencing unlocks barcoded exon connectivity in frozen brain tissue

Hardwick, S. A., Hu, W., Joglekar, A., Fan, L., Collier, P. G., Foord, C., Balacco, J., Lanjewar, S., Sampson, M. M. G., Koopmans, F., Prjibelski, A. D., Mikheenko, A., Belchikov, N., Jarroux, J., Lucas, A. B., Palkovits, M., Luo, W., Milner, T. A., Ndhlovu, L. C., Smit, A. B. еще 10, Trojanowski, J. Q., Lee, V. M. Y., Fedrigo, O., Sloan, S. A., Tombácz, D., Ross, M. E., Jarvis, E., Boldogkői, Z., Gan, L. & Tilgner, H. U., июл 2022, в: Nature Biotechnology. 40, 7, стр. 1082-1092 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование