Изобретение относится к области медицины, а именно к репродуктологии и методам ЭКО, и может быть использовано для лечения пациенток с бесплодием, вызванным фиброзно-склеротической или гипопластической трансформацией эндометрия при повторных неудачах имплантации в циклах ВРТ в анамнезе. На фоне гормональной терапии на 5-6 день менструального цикла осуществляют комплексную трансплантацию клеточного продукта на основе аутологичных мезенхимальных стволовых клеток костного мозга (МСК КМ), полученных при биопсии гребня подвздошной кости. При этом внутривенно в течение 30-40 мин вводят клеточный продукт объемом 100 мл, содержащий МСК КМ, иммобилизованные в транспортном растворе на основе желатина из расчета 1 млн клеток на кг массы тела пациентки в 100 мл раствора. После чего проводят внутриматочное введение клеточного продукта под контролем УЗИ путем орошения, объемом 1 мл, содержащего 10 млн МСК КМ в аналогичном растворе. Способ обеспечивает повышение эффективности лечения, способствует положительной динамике роста эндометрия и его структуры, повышение результатов наступления клинической беременности пациенток. 2 пр., 5 табл.