В статье рассматривается автоматизация выявления больных острыми респираторными вирусными заболеваниями на ранней стадии с целью профилактики дальнейшего распространения заболеваний в условиях неблагоприятной эпидемиологической обстановки. Постановка задачи: анализ социально-физиологических рисков, влияющих на здоровье военнослужащего, и разработка программного комплекса, сопоставляющего факторы риска, влияющие на развитие острых респираторных вирусных заболеваний с температурой тела, для предотвращения распространения таких заболеваний.