Рассмотрен широкий круг проблем использования морских биоресурсов в зонах национальной юрисдикции. Дан ретроспективный анализ динамики естественных и социально-экономических систем рыболовства. Обсуждены проблемы «провалов» рынка в природопользовании. Особый акцент сделан на использовании методов биоэкономических измерений при переходе к устойчивому рыболовству. Рассмотрены проблемы денежной оценки биоресурсов как природного капитала, а также проблемы налогообложения, прав собственности и прав пользования применительно к морским биоресурсам. Дана оценка результатов аукционной торговли квотами биоресурсов за рубежом и в России. Показана важность воплощения рентных отношений, а также методов математического моделирова-ния в практике регулирования рыболовства.