Устойчивые межвидовые ассоциации, примером которых являются лишайники, формируются на основе функциональной интеграции геномов взаимодействующих организмов – фотобионта и микобионта, что приводит к появлению новых молекулярно-генетических механизмов регуляции. Изучение генетики лишайников началось сравнительно недавно и представляет несомненный
интерес для понимания физиологических, биохимических и генетических механизмов, регулирующих
процессы интеграции, синхронизации и адаптации организмов-партнеров друг к другу и к окружающей среде. Полученные методами in silico, in vivo и in vitro данные позволили обнаружить гены,
приобретенные предками лишайникообразующих грибов и водорослей в результате серии
горизонтальных переносов, а также предположить роль этих генов в процессе лихенизации.
Тем не менее, геномы лишайников исследованы фрагментарно: степень изученности
полногеномных последовательностей отдельных видов фотобионтов и микобионтов различается, а
экспериментальные исследования поддерживаемых в культуре видов проводятся редко. В настоящее
время не существует объекта, являющегося модельным для изучения надорганизменных генетических
систем мико- и фотобионтов.
Одной из задач данного направления исследований является определение модельного объекта
симбиогенетики лишайников. Наши исследования ведутся по следующим направлениям: 1) изучение
методами in silico доступных для анализа геномов и транскриптомов водорослей и лихенизированных
грибов с целью выявления структурных и функциональных особенностей генов и белков, вероятно
способствующих лихенизации; 2) поиск и введение в культуру основных широко распространенных
видов лишайников с целью формирования коллекции образцов, которые в будущем можно будет
использовать для системного анализа лишайникового симбиоза методами in vivo и in vitro. Поиск
модельного объекта и применение методов симбиогенетики для его изучения позволит углубить наши
знания о генетических механизмах формирования симбиотических систем.