Мы представляем pygenomics, пакет на языке Python для работы с геномными интервалами и файлами биоинформационных данных. Пакет реализует операции с интервалами, предоставляет API и CLI, поддерживает чтение и запись данных в широко используемых биоинформатических форматах, включая BAM, BED, GFF3 и VCF. Исходный код pygenomics снабжен внутренней документацией, аннотациями типов и придерживается парадигмы функционального программирования. Эти особенности облегчают беспрепятственную интеграцию процедур pygenomics в скрипты и конвейеры. Пакет реализован на чистом языке Python с использованием только стандартных библиотек и содержит механизмы тестирования на основе их свойств. Также предоставлено сравнение pygenomics с другими биоинформационными пакетами на языке Python в плане возможностей и производительности. Сравнение производительности охватывает операции с геномными интервалами, выравниваниями прочтений и геномными вариантами и демонстрирует, что pygenomics пригоден для проведения эффективного с вычислительной точки зрения анализа.