Инфузории часто выступают в качестве хозяев для различных эндосимбиотических микроорганизмов, как прокариотических, так и эукариотических. Эндосимбионты могут быть цитоплазматическими или внутриядерными и могут отличаться по специфичности в отношении хозяина или компартмента. Число вновь обнаруженных эндосимбионтов инфузорий постоянно растет. Недавно было зарегистрировано два новых эукариотических и два новых прокариотических эндомимбионта из цитоплазмы парамеций (микроспоридия из цитоплазмы Paramecium primaurelia, дрожжи из цитоплазмы P. bursaria, и две бактерии из цитоплазмы P.nephridiatum), а также бактерия из макронуклеуса Spirostomum minus. Эукариотические вселенцы являются новыми для парамеций. Микроспоридия является всего вторым представителем микроспоридий, паразитирующих у инфузорий, который получил полное морфологическое и молекулярное описание.Зараженные дрожжами парамеции редко встречаются в природе, хотя ранее в эксперименте подобные заражения удавались. Статус трех бактериальных эндосимбионтов не определен. Морфология одного из них, имеющего жгутики и локализующегося в симбионтофорной вакуоли, совпадает с морфологией ранее описанного вида Pseudolyticum minutus, который ранее был описан лишь на морфологическом уровне и не до сих пор не охарактеризован с молекулярной точки зрения. Изогнутый цитоплазматический эндосимбионт P.nephridiatum выявляется методом FISH с использованием зондов, специфичных к родам Holospora и Goertzia, оба из которых являются исключительно внутриядерными симбионтами. Однако несмотря на морфологические отличия, предварительная характеристика последовательности гена, кодирующего рРНК малой субъединицы рибосом сближает этого эндосимбионта с видом Paraholospora nucleivisitans. Однако ни один из этих видов ранее не обнаруживался у P.nephridiatum. По данным FISH макронуклеарный эндосимбионт S.minus принадлежит к группе Альфа-протеобактерий, как и описанные ранее; получена моноклональная лабораторная культура, и в настоящее время проводится молекулярная и морфологическая характеристка данной бактерии.
