Тихоокеанская сельдь Clupea pallasii и атлантическая сельдь C. harengus - родственные виды плиоценового возраста, которые со-существуют в северо-восточной Европе. Атлантическая сельдь представлена огромной океанической популяцией и несколькими небольшими прибрежными популяциями в Норвегии, в то время как тихоокеанская сельдь преобладает в восточной части Баренцева и Белого морей. Две популяции в Северной Норвегии, одна из которых обитает в морском Балсфьорде, а другая изолирована в меромиктическом озере Россфиорд, фенотипически сходны с C. pallasii. Ранее было показано, что в генотипе сельди Балсфьорда 75% генов от C. pallasii, а 25 % от C. harengus. Здесь мы изучили сельдь Россфиорда с помощью митохондриального секвенирования и генотипирования микросателлитных и аллозимных локусов. Сельдь Россфиорда похожа, но не идентична сельди Балсфьорда, и имеет примерно 30 % ядерных генов и 50 % мтДНК от атлантической сельди. Митохондриальное разнообразие в Россфиорде ниже, чем в Балсфиорде, причем в двух популяциях нет общих атлантических митохондриальных гаплотипов. Предполагая недавнее общее происхождение этих двух популяций, мы предполагаем, что различия обусловлены генетическим дрейфом и, возможно, независимой гибридизацией с атлантической сельдью. С помощью новых данных мы также подтверили и подтвердили гипотезу Лаакконен и др. (2015) о том, что в Норвегии существуют и другие гибридогенные популяции сельди кроме популяций Россфиорда и Балсфиорда.