Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование
3’:5’-AMP-индуцированный конформационный переход регуляторной субъединицы протеинкиназы А Ia запускается ключевыми остатками A202 И A326; Ч I. / Рогачева, О.Н.; Щеголев, Б.Ф.; Стефанов, В.Е.; Захаров, Г.А.; Савватеева-Попова, E.B.
в: БИОХИМИЯ, Том 77, № 5, 2012, стр. 568-577.Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование
}
TY - JOUR
T1 - 3’:5’-AMP-индуцированный конформационный переход регуляторной субъединицы протеинкиназы А Ia запускается ключевыми остатками A202 И A326; Ч I.
AU - Рогачева, О.Н.
AU - Щеголев, Б.Ф.
AU - Стефанов, В.Е.
AU - Захаров, Г.А.
AU - Савватеева-Попова, E.B.
PY - 2012
Y1 - 2012
N2 - Методами молекулярной динамики и лиганд_рецепторного докинга показано, что ключевым событием, инициируемым 3':5'_AMP при связывании c А_ и В_доменами протеинкиназы А Iα, является образование водородной связи между 3':5'_AMP и A202(A326). Движение амидной группы A202(A326) приводит к переходу короткой 310_спирали фосфатсвязывающей кассеты в более длинную α_спираль. Результатом этого процесса является поворот B_спирали. Вторым условием смещения остатка L203(L327) и «упаковки» его в гидрофобный карман является определенная пространственная ориентация β2β3_петли. В результате затруднен переход в В_конформацию А_ и В_доменов протеинкиназы А Iα, несущих точечные мутации R209K и R333K соответственно. 3':5'_AMP_Связывающий домен в отсутствие 3':5'_AMP тоже переходит в B_конформацию. В данном случае движущей силой смещения амидной группы A202(A326), вероятно, является реорганизация спирали фосфатсвязывающей кассеты в более выгодную α_конформацию.
AB - Методами молекулярной динамики и лиганд_рецепторного докинга показано, что ключевым событием, инициируемым 3':5'_AMP при связывании c А_ и В_доменами протеинкиназы А Iα, является образование водородной связи между 3':5'_AMP и A202(A326). Движение амидной группы A202(A326) приводит к переходу короткой 310_спирали фосфатсвязывающей кассеты в более длинную α_спираль. Результатом этого процесса является поворот B_спирали. Вторым условием смещения остатка L203(L327) и «упаковки» его в гидрофобный карман является определенная пространственная ориентация β2β3_петли. В результате затруднен переход в В_конформацию А_ и В_доменов протеинкиназы А Iα, несущих точечные мутации R209K и R333K соответственно. 3':5'_AMP_Связывающий домен в отсутствие 3':5'_AMP тоже переходит в B_конформацию. В данном случае движущей силой смещения амидной группы A202(A326), вероятно, является реорганизация спирали фосфатсвязывающей кассеты в более выгодную α_конформацию.
M3 - статья
VL - 77
SP - 568
EP - 577
JO - БИОХИМИЯ
JF - БИОХИМИЯ
SN - 0320-9725
IS - 5
ER -
ID: 5406502