TY - CONF

T1 - Сравнительный анализ микробиоты, ассоциированной с Littorina fabalis и Littorina obtusata

AU - Курячий, Дмитрий Сергеевич

PY - 2023/4/23

Y1 - 2023/4/23

N2 - Ассоциированные микроорганизмы (микробиом) могут играть важную роль вфункционировании своих многоклеточных хозяев. Например, кишечные симбионты мо-гут участвовать в регуляции таких процессов в организме животных как метаболизм,развитие, иммунитет и репродуктивное поведение. Состав микробиома связан с харак-теристиками экологической ниши хозяина. Особенности пищевых предпочтений близко-родственных видов-хозяев и их микробиотопического распределения влияют на спектрвстречаемых, поглощаемых и остающихся в ассоциации микроорганизмов, т.е. на форми-рование видоспецифичного микробиома. Насколько сильно подвержен изменениям составэтого сообщества при экологическом видообразовании - актуальный вопрос эволюцион-ной биологии. Другой важный вопрос - какие факторы, определяющие состав микробногосообщества, являются более значимыми при изменениях: отличия населяемой ниши илифизиологическое сходство расходящихся видов.Для детальной характеристики ассоциированных бактериомов и их изменчивости мы вкачестве организмов-хозяев выбрали пару сестринских видов моллюсков Littorina obtusataи L. fabalis. Это виды криптической группы “obtusata” (Littorina, Neritrema), обитающие всимпатрии. Они тяготеют на литорали к зоне фукоидов; L. fabalis предпочитает в качествесубстрата Fucus serratus (в нижней части литорали и верхней сублиторали), тогда как L.obtusata - F. vesiculosis и Ascophyllum nodosum (в нижней и средней литорали). Гипотети-чески, различия в занимаемых микронишах должны отражаться на наборе микроорганиз-мов, с которым улитки сталкиваются и/или устанавливают стабильные взаимоотношенияв естественных условиях. Различия в составе и свойствах микробных сообществ могут, всвою очередь, влиять на адаптивный потенциал видов. Возможно, отличия в особенностяхассоциированной микробиоты имели важное значение и при дивергенции данных видов.В нашем исследовании мы провели детальный сравнительный анализ бактериомов,ассоциированных с сестринскими видами группы “obtusata”, с учетом сезонной и геогра-фической изменчивости. Сбор образцов проводили в двух регионах (Баренцево море, пос.Дальние Зеленцы и Белое море, мыс Картеш) в разные сезоны. Собирали образцы ниж-них отделов кишки индивидуально для каждой литторины, а также в качестве образцовсравнения - фрагменты мантийного эпителия для анализа поверхностного микробиома; вдополнение были взяты соскобы поверхностных биопленок с различных живых (все пред-ставленные виды фукоидов) и неживых (камни) субстратов. Из образцов была выделенагеномная ДНК бактерий, затем были приготовлены 16S-ДНК-библиотеки, просеквениро-ванные на платформе Illumina MiSeq. Компьютерная обработка включала формированиеASV с использованием алгоритмов QIIME 2. Предварительные результаты позволяют ска-зать, что средовые микробиомы более разнообразны, чем ассоциированные с моллюсками;микробиота поверхности тела моллюсков отличается от кишечной; состав кишечных мик-робных сообществ обладает разной изменчивостью у двух видов.

AB - Ассоциированные микроорганизмы (микробиом) могут играть важную роль вфункционировании своих многоклеточных хозяев. Например, кишечные симбионты мо-гут участвовать в регуляции таких процессов в организме животных как метаболизм,развитие, иммунитет и репродуктивное поведение. Состав микробиома связан с харак-теристиками экологической ниши хозяина. Особенности пищевых предпочтений близко-родственных видов-хозяев и их микробиотопического распределения влияют на спектрвстречаемых, поглощаемых и остающихся в ассоциации микроорганизмов, т.е. на форми-рование видоспецифичного микробиома. Насколько сильно подвержен изменениям составэтого сообщества при экологическом видообразовании - актуальный вопрос эволюцион-ной биологии. Другой важный вопрос - какие факторы, определяющие состав микробногосообщества, являются более значимыми при изменениях: отличия населяемой ниши илифизиологическое сходство расходящихся видов.Для детальной характеристики ассоциированных бактериомов и их изменчивости мы вкачестве организмов-хозяев выбрали пару сестринских видов моллюсков Littorina obtusataи L. fabalis. Это виды криптической группы “obtusata” (Littorina, Neritrema), обитающие всимпатрии. Они тяготеют на литорали к зоне фукоидов; L. fabalis предпочитает в качествесубстрата Fucus serratus (в нижней части литорали и верхней сублиторали), тогда как L.obtusata - F. vesiculosis и Ascophyllum nodosum (в нижней и средней литорали). Гипотети-чески, различия в занимаемых микронишах должны отражаться на наборе микроорганиз-мов, с которым улитки сталкиваются и/или устанавливают стабильные взаимоотношенияв естественных условиях. Различия в составе и свойствах микробных сообществ могут, всвою очередь, влиять на адаптивный потенциал видов. Возможно, отличия в особенностяхассоциированной микробиоты имели важное значение и при дивергенции данных видов.В нашем исследовании мы провели детальный сравнительный анализ бактериомов,ассоциированных с сестринскими видами группы “obtusata”, с учетом сезонной и геогра-фической изменчивости. Сбор образцов проводили в двух регионах (Баренцево море, пос.Дальние Зеленцы и Белое море, мыс Картеш) в разные сезоны. Собирали образцы ниж-них отделов кишки индивидуально для каждой литторины, а также в качестве образцовсравнения - фрагменты мантийного эпителия для анализа поверхностного микробиома; вдополнение были взяты соскобы поверхностных биопленок с различных живых (все пред-ставленные виды фукоидов) и неживых (камни) субстратов. Из образцов была выделенагеномная ДНК бактерий, затем были приготовлены 16S-ДНК-библиотеки, просеквениро-ванные на платформе Illumina MiSeq. Компьютерная обработка включала формированиеASV с использованием алгоритмов QIIME 2. Предварительные результаты позволяют ска-зать, что средовые микробиомы более разнообразны, чем ассоциированные с моллюсками;микробиота поверхности тела моллюсков отличается от кишечной; состав кишечных мик-робных сообществ обладает разной изменчивостью у двух видов.

M3 - тезисы

T2 - XXX Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых «Ломоносов-2023»

Y2 - 10 April 2023 through 21 April 2023

ER -