Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование
ТЕРМОДИНАМИЧЕСКАЯ ОЦЕНКА АКТИВАЦИИ ПРОТЕИНКИНАЗЫ А IБ. / Рогачева, О.Н.; Попов, А.В.; Савватеева-Попова, E.B.; Стефанов, В.Е.; Щеголев, Б.Ф.
в: БИОХИМИЯ, Том 75, № 2, 2010, стр. 286-296.Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование
}
TY - JOUR
T1 - ТЕРМОДИНАМИЧЕСКАЯ ОЦЕНКА АКТИВАЦИИ ПРОТЕИНКИНАЗЫ А IБ
AU - Рогачева, О.Н.
AU - Попов, А.В.
AU - Савватеева-Попова, E.B.
AU - Стефанов, В.Е.
AU - Щеголев, Б.Ф.
PY - 2010
Y1 - 2010
N2 - Проведена термодинамическая оценка активации протеинкиназы А (ПКА) Iб и рассмотрена возможная роль ATP как дополнительного природного регулятора активности данного фермента, а именно ингибито- ра. Работа выполнена с использованием программы докинга QUANTUM 3.3.0 и пакета квантово-химичес- ких программ Gaussian 03W (расчет стэкинг-взаимодействий с учетом эффекта электронной корреляции MP2/6-31G(d) SCRF = IPCM (е = 4,0)). Показано, что активация ПКА Iб, индуцированная 3':5'-AMP и его аналогами, обусловлена двумя процессами: переходом регуляторной субъединицы протеинкиназы в термо- динамически выгодную структурную конформацию, реализующуюся только в присутствии 3':5'-AMP (ДG°R = -23,9 ± 8,2 кДж/моль); и повышением сродства 3':5'-AMP к связывающим сайтам ПКА Iб после сопровождающего активацию протеинкиназы изменения конформации регуляторной субъединицы (ДG°3':5'-AMP = -28,1 ± 9,7 кДж/моль). Продемонстрирована возможность ATP выступать в качестве конкурент- ного ингибитора ПКА Ia, препятствую
AB - Проведена термодинамическая оценка активации протеинкиназы А (ПКА) Iб и рассмотрена возможная роль ATP как дополнительного природного регулятора активности данного фермента, а именно ингибито- ра. Работа выполнена с использованием программы докинга QUANTUM 3.3.0 и пакета квантово-химичес- ких программ Gaussian 03W (расчет стэкинг-взаимодействий с учетом эффекта электронной корреляции MP2/6-31G(d) SCRF = IPCM (е = 4,0)). Показано, что активация ПКА Iб, индуцированная 3':5'-AMP и его аналогами, обусловлена двумя процессами: переходом регуляторной субъединицы протеинкиназы в термо- динамически выгодную структурную конформацию, реализующуюся только в присутствии 3':5'-AMP (ДG°R = -23,9 ± 8,2 кДж/моль); и повышением сродства 3':5'-AMP к связывающим сайтам ПКА Iб после сопровождающего активацию протеинкиназы изменения конформации регуляторной субъединицы (ДG°3':5'-AMP = -28,1 ± 9,7 кДж/моль). Продемонстрирована возможность ATP выступать в качестве конкурент- ного ингибитора ПКА Ia, препятствую
M3 - статья
VL - 75
SP - 286
EP - 296
JO - БИОХИМИЯ
JF - БИОХИМИЯ
SN - 0320-9725
IS - 2
ER -
ID: 5028193