Инфузории являются хозяевами для многочисленных и разнообразных внутриклеточных бактерий. Эндобионты могут аккупировать различные компартменты клетки – поверхность, субкортикальный слой, цитоплазму, перинуклеарное пространство ядер и сами ядра. Наиболее изучены внутриядерные бактерии парамеций (gen.Paramecium, Ciliophora) из рода Holospora. Впервые они были описаны почти 120 лет назад выходцем из Одессы, Владимиром Хавкиным (Hafkin, 1890). В настоящее время описано девять видов Holospora, специфически заселяющие макро- (МА) или микронуклеусы (МИ) разных видов парамеций. Секвенирование полноразмерного гена 16S рРНК и его фрагмента для H.obtusa и H.elegans соответвтвенно, показало, что они относятся к подотделу альфа-Протеобактерий (Ammann et al., 1990). Однако в литературе высказывались предположения о искусственном объединении в роде Holospora неродственных бактерий (Fokin et al., 1997). формируя самостоятельную ветвь, рано дивергировавшую от основного ствола Rickettsia (Emelianov, 2003). В нашей лаборатории