С целью регистрации данных по экспрессии генов сегментации in situ разработан метод регистрации изображений, основанный на сплайн-аппроксимации. В качестве контрольных точек для регистрации использованы координаты экстремумов одномерных картин экспрессии генов. Этот метод регистрации характеризуется очень высокой точностью. Предложен метод создания обобщенной картины экспрессии генов в отдельных клетках. Такие картины сконструированы для 9 генов сегментации, принадлежащих к классам генов gap и pair-rule.