В статье на основе ранее неизвестных архивных документов рассказывается об одном из эпизодов периода становления дипломатических отношений между Россией и Японией, случившемся в 1872 г. Этот эпизод представлял собой дипломатический конфликт, который был вызван арестом двух самураев, принявших Православие и фактически служивших в Российском консульстве в портовом городе Хакодате. Конфликт между Российским консульством и властями Хакодате рассматривается в контексте двухсторонних русско-японских отношений конца 1860-х – начала 1870-х гг. и на фоне событий революции Мэйдзи. Особая значимость конфликта была вызвана тем, что его возникновение и урегулирование были связаны с решением крайне сложного Сахалинского вопроса. Этот конфликтный эпизод иллюстрирует специфические условия, в которых приходилось действовать православной миссии Николая Японского, когда многие действия местных японских властей обусловливались борьбой между консерваторами и прогрессистами, ориентированными на активную вестернизацию Страны Восход