TY - CONF

T1 - Сравнительный метагеномный и культуромный анализ антарктических цианобактерий в водных и почвенных микробиомах оазиса Холмы Ларсеманн

AU - Величко, Наталия Владиславовна

AU - Рабочая, Дарья Евгеньевна

AU - Смирнова, Светлана Викторовна

AU - Макеева, Анастасия Станиславовна

PY - 2024/6/10

Y1 - 2024/6/10

N2 - Микроорганизмы cоставляют основу экосистем антарктических оазисов (свободных от льда прибрежных территорий) - источников биологического разнообразия на континенте. В экстремальных климатических условиях они выживают благодаря способности формировать микробные сообщества в виде матов и биопленок. В водоемах оазисов они распространены в виде бентосных матов и прибрежных биопленок, в наземных экотопах встречаются в поверхностных обрастаниях (биокорках), а также формируют микробиомы гиполитных горизонтов почв (Ellis-Evans et al., 1998; Taton et al., 2008; Velichko et al., 2021). Оксигенные фототрофные бактерии (цианобактерии), входят в состав большинства исследованных нами антарктических сообществ, где часто выступают как формирующий их фототрофный компонент и основной продуцент органического вещества (Velichko et al., 2023). При этом сравнительной оценки их биоразнообразия в почвенных и водных микробиомах до сих пор не проводилось. В представленной работе впервые осуществлено комплексное исследование литоральных матов и почвенных биопленок оазиса Холмы Ларсеманн с помощью метагеномного анализа 23 природных образцов (10 почвенных и 13 водных экотопов) с целью таксономической характеристики состава микробиомов в целом, а также культурального подхода, использованного для изучения 77 штаммов цианобактерий. В работе использовались методы высокопроизводительного секвенирования вариабельных участков гена 16S рРНК, амплифицированных с метагеномной ДНК образцов (Sinclair al., 2015), биоинформтический анализ данных (Bolyen al., 2019), а также полифазный подход идентификации цианобактерий (Komarek, 2016), включающий их морфологическое описание и молекулярно-филогенетическую характеристику. Особое внимание в исследовании было посвящено вопросам эндемизма и культивируемости отдельных групп цианобактерий

AB - Микроорганизмы cоставляют основу экосистем антарктических оазисов (свободных от льда прибрежных территорий) - источников биологического разнообразия на континенте. В экстремальных климатических условиях они выживают благодаря способности формировать микробные сообщества в виде матов и биопленок. В водоемах оазисов они распространены в виде бентосных матов и прибрежных биопленок, в наземных экотопах встречаются в поверхностных обрастаниях (биокорках), а также формируют микробиомы гиполитных горизонтов почв (Ellis-Evans et al., 1998; Taton et al., 2008; Velichko et al., 2021). Оксигенные фототрофные бактерии (цианобактерии), входят в состав большинства исследованных нами антарктических сообществ, где часто выступают как формирующий их фототрофный компонент и основной продуцент органического вещества (Velichko et al., 2023). При этом сравнительной оценки их биоразнообразия в почвенных и водных микробиомах до сих пор не проводилось. В представленной работе впервые осуществлено комплексное исследование литоральных матов и почвенных биопленок оазиса Холмы Ларсеманн с помощью метагеномного анализа 23 природных образцов (10 почвенных и 13 водных экотопов) с целью таксономической характеристики состава микробиомов в целом, а также культурального подхода, использованного для изучения 77 штаммов цианобактерий. В работе использовались методы высокопроизводительного секвенирования вариабельных участков гена 16S рРНК, амплифицированных с метагеномной ДНК образцов (Sinclair al., 2015), биоинформтический анализ данных (Bolyen al., 2019), а также полифазный подход идентификации цианобактерий (Komarek, 2016), включающий их морфологическое описание и молекулярно-филогенетическую характеристику. Особое внимание в исследовании было посвящено вопросам эндемизма и культивируемости отдельных групп цианобактерий

M3 - тезисы

SP - 27

T2 - VII Всероссийская научная конференция с международным участием «Водоросли: проблемы таксономии и экологии, использование в мониторинге и биотехнологии»

Y2 - 16 September 2024 through 20 September 2024

ER -