Standard

ОБРАЗОВАНИЕ ЦВИТТЕРИОННОЙ СТРУКТУРЫ ГЛИЦИНА И АЛАНИНА В РАМКАХ ДИСКРЕТНО-КОНТИНУАЛЬНОЙ МОДЕЛИ ВОДНОГО РАСТВОРИТЕЛЯ: ВНУТРИМОЛЕКУЛЯРНЫЙ ПЕРЕНОС ПРОТОНА. / Крауклис, Ирина Валерьевна; Чижов, Юрий Владимирович; Тулуб, Александр Владимирович; Алексеева, Валентина Андреевна.

в: ЖУРНАЛ СТРУКТУРНОЙ ХИМИИ, Том 65, № 11, 136009, 2024.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Harvard

Крауклис, ИВ, Чижов, ЮВ, Тулуб, АВ & Алексеева, ВА 2024, 'ОБРАЗОВАНИЕ ЦВИТТЕРИОННОЙ СТРУКТУРЫ ГЛИЦИНА И АЛАНИНА В РАМКАХ ДИСКРЕТНО-КОНТИНУАЛЬНОЙ МОДЕЛИ ВОДНОГО РАСТВОРИТЕЛЯ: ВНУТРИМОЛЕКУЛЯРНЫЙ ПЕРЕНОС ПРОТОНА', ЖУРНАЛ СТРУКТУРНОЙ ХИМИИ, Том. 65, № 11, 136009. https://doi.org/10.26902/jsc_id136009

APA

Крауклис, И. В., Чижов, Ю. В., Тулуб, А. В., & Алексеева, В. А. (2024). ОБРАЗОВАНИЕ ЦВИТТЕРИОННОЙ СТРУКТУРЫ ГЛИЦИНА И АЛАНИНА В РАМКАХ ДИСКРЕТНО-КОНТИНУАЛЬНОЙ МОДЕЛИ ВОДНОГО РАСТВОРИТЕЛЯ: ВНУТРИМОЛЕКУЛЯРНЫЙ ПЕРЕНОС ПРОТОНА. ЖУРНАЛ СТРУКТУРНОЙ ХИМИИ, 65(11), [136009]. https://doi.org/10.26902/jsc_id136009

Vancouver

Крауклис ИВ, Чижов ЮВ, Тулуб АВ, Алексеева ВА. ОБРАЗОВАНИЕ ЦВИТТЕРИОННОЙ СТРУКТУРЫ ГЛИЦИНА И АЛАНИНА В РАМКАХ ДИСКРЕТНО-КОНТИНУАЛЬНОЙ МОДЕЛИ ВОДНОГО РАСТВОРИТЕЛЯ: ВНУТРИМОЛЕКУЛЯРНЫЙ ПЕРЕНОС ПРОТОНА. ЖУРНАЛ СТРУКТУРНОЙ ХИМИИ. 2024;65(11). 136009. https://doi.org/10.26902/jsc_id136009

Author

Крауклис, Ирина Валерьевна ; Чижов, Юрий Владимирович ; Тулуб, Александр Владимирович ; Алексеева, Валентина Андреевна. / ОБРАЗОВАНИЕ ЦВИТТЕРИОННОЙ СТРУКТУРЫ ГЛИЦИНА И АЛАНИНА В РАМКАХ ДИСКРЕТНО-КОНТИНУАЛЬНОЙ МОДЕЛИ ВОДНОГО РАСТВОРИТЕЛЯ: ВНУТРИМОЛЕКУЛЯРНЫЙ ПЕРЕНОС ПРОТОНА. в: ЖУРНАЛ СТРУКТУРНОЙ ХИМИИ. 2024 ; Том 65, № 11.

BibTeX

@article{ac064045d1a4438ead125bd8bd195732,
title = "ОБРАЗОВАНИЕ ЦВИТТЕРИОННОЙ СТРУКТУРЫ ГЛИЦИНА И АЛАНИНА В РАМКАХ ДИСКРЕТНО-КОНТИНУАЛЬНОЙ МОДЕЛИ ВОДНОГО РАСТВОРИТЕЛЯ: ВНУТРИМОЛЕКУЛЯРНЫЙ ПЕРЕНОС ПРОТОНА",
abstract = "Представлены результаты квантово-химического моделирования нейтральных и цвиттерионных конформеров глицина (Gly) и аланина (L-Ala) на уровне теории функционала плотности B3LYP+GD3/def2TZVPP в газовой фазе и с учетом влияния водной среды в рамках дискретно-континуальной модели. Наиболее стабильными нейтральными конформерами Gly и Ala в газовой фазе оказались структуры с минимальными дипольными моментами. При учете сольватационных эффектов в рамках модели поляризуемого континуума (РСМ) энергетически выгодными становятся конформеры с максимальными дипольными моментами за счет диполь-дипольного взаимодействия со средой. Рассчитаны активационные барьеры реакции внутримолекулярного переноса протона при формировании изучаемых цвиттерионов в зависимости от числа молекул воды, находящихся в первой координационной сфере. Показано, что включение в дискретно-континуальную модель водного растворителя семи молекул воды, насыщающих водородные связи функциональных групп –NH3+ и –COO-, значительно понижает величину активационного барьера у глицина до 0.02 kcal/mol и у аланина до 0.09 kcal/mol.",
author = "Крауклис, {Ирина Валерьевна} and Чижов, {Юрий Владимирович} and Тулуб, {Александр Владимирович} and Алексеева, {Валентина Андреевна}",
year = "2024",
doi = "10.26902/jsc_id136009",
language = "русский",
volume = "65",
journal = "ЖУРНАЛ СТРУКТУРНОЙ ХИМИИ",
issn = "0136-7463",
publisher = "ИНХ СО РАН",
number = "11",

}

RIS

TY - JOUR

T1 - ОБРАЗОВАНИЕ ЦВИТТЕРИОННОЙ СТРУКТУРЫ ГЛИЦИНА И АЛАНИНА В РАМКАХ ДИСКРЕТНО-КОНТИНУАЛЬНОЙ МОДЕЛИ ВОДНОГО РАСТВОРИТЕЛЯ: ВНУТРИМОЛЕКУЛЯРНЫЙ ПЕРЕНОС ПРОТОНА

AU - Крауклис, Ирина Валерьевна

AU - Чижов, Юрий Владимирович

AU - Тулуб, Александр Владимирович

AU - Алексеева, Валентина Андреевна

PY - 2024

Y1 - 2024

N2 - Представлены результаты квантово-химического моделирования нейтральных и цвиттерионных конформеров глицина (Gly) и аланина (L-Ala) на уровне теории функционала плотности B3LYP+GD3/def2TZVPP в газовой фазе и с учетом влияния водной среды в рамках дискретно-континуальной модели. Наиболее стабильными нейтральными конформерами Gly и Ala в газовой фазе оказались структуры с минимальными дипольными моментами. При учете сольватационных эффектов в рамках модели поляризуемого континуума (РСМ) энергетически выгодными становятся конформеры с максимальными дипольными моментами за счет диполь-дипольного взаимодействия со средой. Рассчитаны активационные барьеры реакции внутримолекулярного переноса протона при формировании изучаемых цвиттерионов в зависимости от числа молекул воды, находящихся в первой координационной сфере. Показано, что включение в дискретно-континуальную модель водного растворителя семи молекул воды, насыщающих водородные связи функциональных групп –NH3+ и –COO-, значительно понижает величину активационного барьера у глицина до 0.02 kcal/mol и у аланина до 0.09 kcal/mol.

AB - Представлены результаты квантово-химического моделирования нейтральных и цвиттерионных конформеров глицина (Gly) и аланина (L-Ala) на уровне теории функционала плотности B3LYP+GD3/def2TZVPP в газовой фазе и с учетом влияния водной среды в рамках дискретно-континуальной модели. Наиболее стабильными нейтральными конформерами Gly и Ala в газовой фазе оказались структуры с минимальными дипольными моментами. При учете сольватационных эффектов в рамках модели поляризуемого континуума (РСМ) энергетически выгодными становятся конформеры с максимальными дипольными моментами за счет диполь-дипольного взаимодействия со средой. Рассчитаны активационные барьеры реакции внутримолекулярного переноса протона при формировании изучаемых цвиттерионов в зависимости от числа молекул воды, находящихся в первой координационной сфере. Показано, что включение в дискретно-континуальную модель водного растворителя семи молекул воды, насыщающих водородные связи функциональных групп –NH3+ и –COO-, значительно понижает величину активационного барьера у глицина до 0.02 kcal/mol и у аланина до 0.09 kcal/mol.

UR - https://jsc.niic.nsc.ru/article/136009/

UR - https://www.mendeley.com/catalogue/646448c2-8324-3e3d-8fdc-2397ef972c45/

U2 - 10.26902/jsc_id136009

DO - 10.26902/jsc_id136009

M3 - статья

VL - 65

JO - ЖУРНАЛ СТРУКТУРНОЙ ХИМИИ

JF - ЖУРНАЛ СТРУКТУРНОЙ ХИМИИ

SN - 0136-7463

IS - 11

M1 - 136009

ER -

ID: 124350378