Предложена методология сравнительной оценки эффективности и экологической опасности внесения пестицидов в почву с учетом погодных условий, характерных для данной местности, на основе синтеза полевого, лабораторного и компьютерного экспериментов. Рассмотрены вопросы, связанные с определением параметров имитационной модели, и разработана схема компьютерного эксперимента, включающая статистическое моделирование. С использованием разработанного подхода на примере внесения пестицидов разного фитосанитарного назначения изучено влияние минеральных удобрений и погодных условий на основные процессы, определяющие поведение пестицидов в почве и величину эффективной дозы препарата.