Задача оптимизации динамики пучка в линейном ускорителе сводится к отысканию глобального минимума функционала качества в многомерном пространстве параметров. Для решения задачи применяется генетический стохастический алгоритм, основанный на моделировании многомерного нормального распределения с адаптацией ковариационной матрицы, при этом вычисления матрицы не требуется. Введена модификация алгоритма, связанная с делением каждого поколения на группы, для которых используются различные среднеквадратические отклонения. Это позволяет избежать быстрого стягивания выборки в точку локального экстремума. Проведенная оптимизация существенно улучшила характеристики пучка электронов.