До последнего времени в организациях и на предприятиях Ленинграда и области формировалось немало программ, которые как по своей структуре, так и по содержанию не соответствуют общим требованиям, предъявляемым к целевым комплексным программам. Многие организации, занимающиеся вопросами методического обеспечения программно-целевого планирования, практической разработки и реализации программ, неоправданно замыкают свою деятельность на узковедомственных целях. Негативное влияние на качество программно-целевого планирования оказывает и то, что далеко не всегда соблюдается принцип приоритетности финансирования программ по сравнению с другими плановыми заданиями. Отмечена важность программно-целевых подходов в разрешении межотраслевых и межведомственных проблем Ленинградского региона.