Впервые выполнены эллипсометрические измерения спектров брэгговского отражения света от трехмерных фотонных кристаллов в условиях, когда проявляются эффекты многоволновой дифракции света. Проанализированы спектры параметров Стокса и фазового сдвига между s- и p-компонентами поляризации дифрагированного света. Обнаружено уменьшение полной степени поляризации отраженного света в области фотонной стоп-зоны, связанное со структурным разупорядочением фотоннокристаллического образца.