TY - CHAP

T1 - Антарктические микробиомы с участием цианобактерий: метагеномный и культуромный методы анализа

AU - Величко, Наталия Владиславовна

AU - Рабочая, Дарья Евгеньевна

AU - Смирнова, Светлана Викторовна

AU - Макеева, Анастасия Станиславовна

AU - Райко, Михаил Петрович

PY - 2025/6/30

Y1 - 2025/6/30

N2 - В работе впервые изучено таксономическое разнообразие 50 антарктических альго-бактериальных сообществ с помощью метабаркодирования 16S рРНК и последующего биоинформатического анализа. Согласно полученным результатам в изученных микробиомах преобладают представители фил Сyanobacteria (от 35% до 65% ASV), Proteobacteria (8-20% ASV), Bacteroidetes (6-14% ASV) и Chloroflexi (5-20% ASV). В качестве минорного компонента в микробиомах встречаются Actinobacteria (2,5-3,5% ASV), Planctomycetes (4-8% ASV) и Acidobacteria (2-2,5% ASV). Доминирующие в изученных микробиомах оксигенные фототрофные бактерии (цианобактерии), были выделены в лабораторные альгологически чистые культуры. На основе этого была сформирована рабочая коллекция антарктических изолятов цианобактерий (более 70), включающая как психрофильные, так и психротолерантные формы. Основу рабочей коллекции составили представители порядков Leptolyngbyales(Phormidesmis spp., Stenomitos spp., Leptolyngbya spp., Drouetiella sp.) и Nostocales (Nostoc spp., Calothrix sp., Coleodesmium sp., Halotia sp.), а также новые и потенциально эндемичные таксоны одноклеточных цианобактерий. Культивируемые антарктические цианобактерии были описаны с помощью современных методов полифазной таксономии (основанной на анализе комплекса морфологических и молекулярнофилогенетических признаков) и задепонированы в коллекции культур микроорганизмов CALU. Проведенное исследование позволяет в целом оценить таксономическое разнообразие антарктических микробных сообществ с участием цианобактерий. Полученные штаммы психрофильных цианобактерий могут быть использованы для изучения метаболических особенностей микроорганизмов холодных мест обитаний, а также в качестве перспективных биотехнологических продуцентов вторичных метаболитов, в том числе холодоустойчивых ферментов и внеклеточных полисахаридов. Работа выполнена при финансовой поддержке гранта РНФ №22-24-00590 на базе Ресурсных Центров Научного парка СПбГУ «Развитие молекулярных и клеточных технологий», «Культивирование микроорганизмов», «Хромас» и «Биобанк».

AB - В работе впервые изучено таксономическое разнообразие 50 антарктических альго-бактериальных сообществ с помощью метабаркодирования 16S рРНК и последующего биоинформатического анализа. Согласно полученным результатам в изученных микробиомах преобладают представители фил Сyanobacteria (от 35% до 65% ASV), Proteobacteria (8-20% ASV), Bacteroidetes (6-14% ASV) и Chloroflexi (5-20% ASV). В качестве минорного компонента в микробиомах встречаются Actinobacteria (2,5-3,5% ASV), Planctomycetes (4-8% ASV) и Acidobacteria (2-2,5% ASV). Доминирующие в изученных микробиомах оксигенные фототрофные бактерии (цианобактерии), были выделены в лабораторные альгологически чистые культуры. На основе этого была сформирована рабочая коллекция антарктических изолятов цианобактерий (более 70), включающая как психрофильные, так и психротолерантные формы. Основу рабочей коллекции составили представители порядков Leptolyngbyales(Phormidesmis spp., Stenomitos spp., Leptolyngbya spp., Drouetiella sp.) и Nostocales (Nostoc spp., Calothrix sp., Coleodesmium sp., Halotia sp.), а также новые и потенциально эндемичные таксоны одноклеточных цианобактерий. Культивируемые антарктические цианобактерии были описаны с помощью современных методов полифазной таксономии (основанной на анализе комплекса морфологических и молекулярнофилогенетических признаков) и задепонированы в коллекции культур микроорганизмов CALU. Проведенное исследование позволяет в целом оценить таксономическое разнообразие антарктических микробных сообществ с участием цианобактерий. Полученные штаммы психрофильных цианобактерий могут быть использованы для изучения метаболических особенностей микроорганизмов холодных мест обитаний, а также в качестве перспективных биотехнологических продуцентов вторичных метаболитов, в том числе холодоустойчивых ферментов и внеклеточных полисахаридов. Работа выполнена при финансовой поддержке гранта РНФ №22-24-00590 на базе Ресурсных Центров Научного парка СПбГУ «Развитие молекулярных и клеточных технологий», «Культивирование микроорганизмов», «Хромас» и «Биобанк».

M3 - тезисы в сборнике материалов конференции

SP - 31

BT - IV МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ «Сохранение и преумножение генетических ресурсов микроорганизмов» г. Санкт-Петербург, 2025

CY - Санкт-Петербург

ER -