В работе представлена автоматизированная система и соответствующее программное обеспечение для оценки эффективности алгоритмов по функции доверительной трудоемкости. В заданном диапазоне входных данных доверительная трудоемкость вычисляется автоматически на основе эмпирического анализа программной реализации. В систему можно добавлять собственные реализации алгоритмов для анализа. Разработанная система полезна при сравнительном анализе с целью выбора наиболее эффективных алгоритмов и их программных реализаций при создании эффективных программных средств для бортовых вычислительных систем, работающих в режиме реального времени.