Проведено исследование влияния напочвенных лишайников Flavocetraria cucullataи Certraria laevigataна химические, биохимические и микробиологические характеристики мерзлотных почв Центральной Якутии. Химический анализ не выявил значимых различий в показателях содержания гумуса, обменных катионов и pH в почвах под лишайниками F. cucullata и C. laevigata и на сопредельных с ними участках, лишенных растительного покрова. Выявлено, что основными вторичными метаболитами F. cucullata являлись усниновая, лихестериновая, протолихестериновая и алло-протолихестериновая кислоты, C. laevigata - фумарпротоцетраровая кислота. Хроматографический анализ почв выявил наличие только усниновой кислоты в образцах гумуса под F. cucullata и на сопредельных с ней участках. Показано, что по мере удаления от места произрастания F. cucullata наблюдалось понижение содержания усниновой кислоты и повышение содержания специфических соединений, которые могут являться биомаркерами грибов в почве. Анализ грибов и бактерий в почвах, выполненный с использованием культурального подхода, показал обилие быстрорастущих микромицетов и бактерий. По данным метагеномного анализа таксономическое разнообразие грибов в почвах было выше, чем по данным культуральных исследований, а преобладающей экологической группой были микоризные базидиомицеты. Показано, что эктомикоризные базидиомицеты в первую очередь подвержены воздействию лишайника F. cucullata. При этом аллелопатический эффект C. laevigataна почвенный микробиом выражен значительно слабее. Предположено, что синтезируемая F. cucullata усниновая кислота диффузно распространяется и накапливается в почве, избирательно подавляя рост эктомикоризных базидиомицетов.