Работа посвящена исследованию методов повышения качества построения эффективных систем защиты информации. В работе предлагается метод контроля за корректным применением средств защиты информации, которыми располагает система защиты информации. Для реализации метода используется алгоритм расчета хэш-сумм. Проведено сравнение эффективности работы систем, использующей предложенный метод и без него в вопросе вносимых задержек обслуживания для систем с поэтапным обслуживанием поступающих запросов в систему. Показано, что системы, использующие данный метод уступают во вносимых задержках обслуживания. Однако, при этом, метод позволяет повысить степень защищенности системы от сложных информационных атак, за счет контроля порядка применения средств защиты.