Данная статья посвящена проблеме функционирования медицинских организаций и региональных систем здравоохранения в условиях пандемии. В большинстве стран нагрузка на систему здравоохранения критически возросла, что привело к неспособности систем к выполнению своих функций. В то же время отдельные организации и региональные медицинские кластеры в разных странах продемонстрировали способность противостоять вызовам пандемии. В данной статье предполагается выявить ключевые факторы обеспечения конкурентоспособности региональных медицинских кластеров и разработать методику оценки уровня конкурентоспособности учреждения в условиях пандемии. Методика оценки построена на основе модифицированных матриц конкурентоспособности, опирающихся на матричные стратегические механизмы. На первый план выходят механизмы оценки медицинских учреждений и кластеров, которые бы смогли обеспечить контроль системы здравоохранения в обычной ситуации и отслеживать ее готовность к возникновению пиковых нагрузок. Это позволит переносить успешные стратегические практики лидеров медицинского рынка на других его игроков и поддерживать работоспособность системы здравоохранения даже в периоды возникновения мировых пандемий