В статье исследована система государственного финансирования научно-инновационной деятельности малого и среднего предпринимательства (МСП), а также деятельность ключевых государственных институтов финансовой поддержки Швейцарии. Инновационный вектор развития экономики с ориентацией на собственные финансовые ресурсы, развитую национальную научно-образовательную среду, а также механизмы налогового стимулирования научно-инновационной деятельности крупных, малых и средних предприятий на уровне регионов позволили Швейцарии стать одним из лидеров мирового рынка инноваций. Данный опыт целесообразно использовать в России для многоканальной и адресной финансовой поддержки инновационной деятельности предприятий, выполняющих научные исследования по приоритетным направлениям научно-технологического развития и ориентированных на создание наукоемкой продукции. Опыт Швейцарии полезен при совершенствовании механизмов интеграции академической и университетской науки с государственными и негосударственными организациями МСП в целях ускорения коммерциализации научных разработок и развития международного сетевого сотрудничества.