Standard

Методы «прогулки по геному» на основе ПЦР (обзор). / Окулова, Елена Сергеевна; Бурлаковский, Михаил Сергеевич; Лутова, Людмила Алексеевна.

в: ЭКОЛОГИЧЕСКАЯ ГЕНЕТИКА, Том 22, № 1, 09.05.2024, стр. 75-104.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхОбзорная статьяРецензирование

Harvard

APA

Vancouver

Author

BibTeX

@article{6d1a03ba4aa649738b4c56aed0bc90fc,
title = "Методы «прогулки по геному» на основе ПЦР (обзор)",
abstract = "В обзоре рассматриваются ряд классических и современных методов, позволяющих установить нуклеотидную последовательность неизвестных участков ДНК, фланкирующих известные. Они применяются для расшифровки регуляторных областей генов, определения сайтов встраивания Т-ДНК или вирусов и т. д., в тех случаях, когда использование полногеномного секвенирования неоправданно. Чтобы амплифицировать участок ДНК, к концу неизвестной последовательность необходимо добавить участок связывания для праймера; это реализуется либо путем лигирования адаптера, либо посадкой вырожденного праймера в мягких условиях, либо закольцовыванием фрагмента ДНК, чтобы изучаемый участок оказался окружен известными. Второй важной задачей является избавление от неизбежно возникающих продуктов неспецифического связывания адаптеров либо вырожденных праймеров — чаще всего данная проблема разрешается несколькими раундами вложенной ПЦР. Разные методы существенно отличаются по трудоемкости, распространенности и доступности необходимых реактивов.",
author = "Окулова, {Елена Сергеевна} and Бурлаковский, {Михаил Сергеевич} and Лутова, {Людмила Алексеевна}",
year = "2024",
month = may,
day = "9",
doi = "10.17816/ecogen624820",
language = "русский",
volume = "22",
pages = "75--104",
journal = "ЭКОЛОГИЧЕСКАЯ ГЕНЕТИКА",
issn = "1811-0932",
publisher = "Эко-Вектор",
number = "1",

}

RIS

TY - JOUR

T1 - Методы «прогулки по геному» на основе ПЦР (обзор)

AU - Окулова, Елена Сергеевна

AU - Бурлаковский, Михаил Сергеевич

AU - Лутова, Людмила Алексеевна

PY - 2024/5/9

Y1 - 2024/5/9

N2 - В обзоре рассматриваются ряд классических и современных методов, позволяющих установить нуклеотидную последовательность неизвестных участков ДНК, фланкирующих известные. Они применяются для расшифровки регуляторных областей генов, определения сайтов встраивания Т-ДНК или вирусов и т. д., в тех случаях, когда использование полногеномного секвенирования неоправданно. Чтобы амплифицировать участок ДНК, к концу неизвестной последовательность необходимо добавить участок связывания для праймера; это реализуется либо путем лигирования адаптера, либо посадкой вырожденного праймера в мягких условиях, либо закольцовыванием фрагмента ДНК, чтобы изучаемый участок оказался окружен известными. Второй важной задачей является избавление от неизбежно возникающих продуктов неспецифического связывания адаптеров либо вырожденных праймеров — чаще всего данная проблема разрешается несколькими раундами вложенной ПЦР. Разные методы существенно отличаются по трудоемкости, распространенности и доступности необходимых реактивов.

AB - В обзоре рассматриваются ряд классических и современных методов, позволяющих установить нуклеотидную последовательность неизвестных участков ДНК, фланкирующих известные. Они применяются для расшифровки регуляторных областей генов, определения сайтов встраивания Т-ДНК или вирусов и т. д., в тех случаях, когда использование полногеномного секвенирования неоправданно. Чтобы амплифицировать участок ДНК, к концу неизвестной последовательность необходимо добавить участок связывания для праймера; это реализуется либо путем лигирования адаптера, либо посадкой вырожденного праймера в мягких условиях, либо закольцовыванием фрагмента ДНК, чтобы изучаемый участок оказался окружен известными. Второй важной задачей является избавление от неизбежно возникающих продуктов неспецифического связывания адаптеров либо вырожденных праймеров — чаще всего данная проблема разрешается несколькими раундами вложенной ПЦР. Разные методы существенно отличаются по трудоемкости, распространенности и доступности необходимых реактивов.

U2 - 10.17816/ecogen624820

DO - 10.17816/ecogen624820

M3 - Обзорная статья

VL - 22

SP - 75

EP - 104

JO - ЭКОЛОГИЧЕСКАЯ ГЕНЕТИКА

JF - ЭКОЛОГИЧЕСКАЯ ГЕНЕТИКА

SN - 1811-0932

IS - 1

ER -

ID: 130918429