Множественная миелома (ММ) — второе по уровню заболеваемости онкогематологическое заболевание, характеризующееся гиперпролиферацией плазматических клеток в костном
мозге (КМ). Встречается преимущественно у лиц старшего возраста. Причины развития ММ не ясны. Предполагается генетическая предрасположенность, возможны эндогенные или внешние
генотоксические воздействия. Окончательно не изучены и молекулярные механизмы лекарственной резистентности и прогрессирования болезни.
Цель работы. С применением NGS изучить динамику генетических изменений, ассоциированных с развитием и прогрессированием
ММ.
Материалы и методы. Для секвенирования расширенного экзома опухолевых клеток на разных стадиях болезни использовали ДНК
плазматических CD138+
клеток КМ, полученных в дебюте заболевания, через 100 дней после трансплантации аутологичных гемопоэтических стволовых клеток (АутоТГСК) и еще через 6 месяцев после
АутоТГСК. В качестве контроля использовали ДНК лимфоцитов периферической крови. Длина коротких парных прочтений составляла
2*110 п.о. со средним покрытием 100. Для коротких прочтений проводили оценку качества. Выравнивания и генотипирование для наследуемых и соматических мутаций производили с использованием
подхода, рекомендованного GATK Best Practices Workflows. Анализ
мутационных подписей осуществляли с использованием SigProfiler.
Результаты и обсуждение. Были выявлены наследуемые мутации и варианты, связанные с чувствительностью к противоопухолевым препаратам. При анализе соматических мутаций были выявлены мутации в генах, ассоциированных с развитием ММ. Анализ
мутационных подписей показал наличие подписей, которые характерны для ММ, а также изменение соотношения подписей по мере
развития болезни. Дебют заболевания характеризуется большим
числом генетических изменений, чем последующие фазы болезни.
Заключение. Исследование генома клеток опухоли в разных временных точках позволило провести анализ генетических изменений,
возникающих у пациентов с ММ при лечении различными препаратами. Выявление наследственных и соматических генетических вариаций, характерных для ММ, необходимо для совершенствования
методов ранней диагностики, прогнозирования течения и разработки
схем лечения заболевания, учитывающих генетические особенности
развития болезни.
Работа поддержана грантом РНФ № 20-15-00081. Работа Жук А.С.
выполнена при государственной финансовой поддержке ведущих
университетов Российской Федерации в рамках программы ITMO
Fellowship and Professorship Program.
