Pattern of taar5 expression in the human brain based on transcriptome datasets analysis

Vaganova, A. N., Murtazina, R. Z., Shemyakova, T. S., Prjibelski, A. D., Katolikova, N. V. & Gainetdinov, R. R., 16 авг 2021, в: International Journal of Molecular Sciences. 22, 16, 18 стр., 8802.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Systematic assessment of long-read RNA-seq methods for transcript identification and quantification

Brooks, A., Pardo-Palacios, F., Reese, F., Carbonell-Sala, S., Diekhans, M., Liang, C., Wang, D., Williams, B., Adams, M., Behera, A., Lagarde, J., Li, H., Пржибельский, А., Balderrama-Gutierrez, G., Çelik, M. H., María, M. D., Denslow, N., Garcia-Reyero, N., Goetz, S., Hunter, M. еще 17, Loveland, J., Menor, C., Moraga, D., Mudge, J., Takahashi, H., Tang, A., Youngworth, I., Carninci, P., Guigó, R., Tilgner, H. U., Wold, B., Vollmers, C., Sheynkman, G., Frankish, A., Au, K. F., Conesa, A. & Mortazavi, A., 3 авг 2021, (Отправлено) в: Nature Methods.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A spatially resolved brain region- and cell type-specific isoform atlas of the postnatal mouse brain

Joglekar, A., Prjibelski, A., Mahfouz, A., Collier, P., Lin, S., Schlusche, A. K., Marrocco, J., Williams, S. R., Haase, B., Hayes, A., Chew, J. G., Weisenfeld, N. I., Wong, M. Y., Stein, A. N., Hardwick, S. A., Hunt, T., Wang, Q., Dieterich, C., Bent, Z., Fedrigo, O. еще 10, Sloan, S. A., Risso, D., Jarvis, E. D., Flicek, P., Luo, W., Pitt, G. S., Frankish, A., Smit, A. B., Ross, M. E. & Tilgner, H. U., 19 янв 2021, в: Nature Communications. 12, 1, 16 стр., 463.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Understanding complex dynamics of behavioral, neurochemical and transcriptomic changes induced by prolonged chronic unpredictable stress in zebrafish

Demin, K. A., Lakstygal, A. M., Krotova, N. A., Masharsky, A., Tagawa, N., Chernysh, M. V., Ilyin, N. P., Taranov, A. S., Galstyan, D. S., Derzhavina, K. A., Levchenko, N. A., Kolesnikova, T. O., Mor, M. S., Vasyutina, M. L., Efimova, E. V., Katolikova, N., Prjibelski, A. D., Gainetdinov, R. R., de Abreu, M. S., Amstislavskaya, T. G. еще 2, Strekalova, T. & Kalueff, A. V., дек 2020, в: Scientific Reports. 10, 1, 19981.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Human pericentromeric tandemly repeated DNA is transcribed at the end of oocyte maturation and is associated with membraneless mitochondria-associated structures

Dobrynin, M. A., Korchagina, N. M., Prjibelski, A. D., Shafranskaya, D., Ostromyshenskii, D. I., Shunkina, K., Stepanova, I., Kotova, A. V., Podgornaya, O. I. & Enukashvily, N. I., 12 ноя 2020, в: Scientific Reports. 10, 1, 15 стр., 19634.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Liquid drop of DNA libraries reveals total genome information

Terekhov, S. S., Eliseev, I. E., Ovchinnikova, L. A., Kabilov, M. R., Prjibelski, A. D., Tupikin, A. E., Smirnov, I. V., Belogurov, A. A., Severinov, K. V., Lomakin, Y. A., Altman, S. & Gabibov, A. G., 3 ноя 2020, в: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 117, 44, стр. 27300-27306 7 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Seed transcriptome annotation reveals enhanced expression of genes related to ros homeostasis and ethylene metabolism at alternating temperatures in wild cardoon

Huarte, H. R., Puglia, G. D., Prjibelski, A. D. & Raccuia, S. A., сен 2020, в: Plants. 9, 9, стр. 1-19 19 стр., 1225.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Hybrid transcriptome sequencing approach improved assembly and gene annotation in Cynara cardunculus (L.)

Puglia, G. D., Prjibelski, A. D., Vitale, D., Bushmanova, E., Schmid, K. J. & Raccuia, S. A., 21 авг 2020, в: BMC Genomics. 21, 1, 17 стр., 317.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Extending rnaSPAdes functionality for hybrid transcriptome assembly

Prjibelski, A. D., Puglia, G. D., Antipov, D., Bushmanova, E., Giordano, D., Mikheenko, A., Vitale, D. & Lapidus, A., 24 июл 2020, в: BMC Bioinformatics. 21, Suppl 12, стр. 302 9 стр., 302.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Using SPAdes De Novo Assembler

Prjibelski, A., Antipov, D., Meleshko, D., Lapidus, A. & Korobeynikov, A., 19 июн 2020, в: Current Protocols in Bioinformatics. 70, 1, e102.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование