1. 2023
  2. Accurate isoform discovery with IsoQuant using long reads

    Prjibelski, A. D., Lapidus, A. L., Joglekar, A., Smetanin, A., Mikheenko, A., Jarroux, J. & Tilgner, H. U., июл 2023, в: Nature Biotechnology. 41, 7, стр. 915-918 4 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  3. WebQUAST: online evaluation of genome assemblies

    Михеенко, А. А., Савельев, В. В., Hirsch, P. & Гуревич, А. А., 17 мая 2023, в: Nucleic Acids Research. 51, W1, стр. 601-606 6 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  4. 2022
  5. Fast and accurate mapping of long reads to complete genome assemblies with VerityMap

    Bzikadze, A., Mikheenko, A. & Певзнер, П. А., 15 ноя 2022, (Электронная публикация перед печатью) в: Genome Research.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  6. Single-nuclei isoform RNA sequencing unlocks barcoded exon connectivity in frozen brain tissue

    Hardwick, S. A., Hu, W., Joglekar, A., Fan, L., Collier, P. G., Foord, C., Balacco, J., Lanjewar, S., Sampson, M. M. G., Koopmans, F., Prjibelski, A. D., Mikheenko, A., Belchikov, N., Jarroux, J., Lucas, A. B., Palkovits, M., Luo, W., Milner, T. A., Ndhlovu, L. C., Smit, A. B. еще 10, Trojanowski, J. Q., Lee, V. M. Y., Fedrigo, O., Sloan, S. A., Tombácz, D., Ross, M. E., Jarvis, E., Boldogkői, Z., Gan, L. & Tilgner, H. U., июл 2022, в: Nature Biotechnology. 40, 7, стр. 1082-1092 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  7. Chasing perfection: validation and polishing strategies for telomere-to-telomere genome assemblies

    Mc Cartney, A. M., Shafin, K., Alonge, M., Bzikadze, A. V., Formenti, G., Fungtammasan, A., Howe, K., Jain, C., Koren, S., Logsdon, G. A., Miga, K. H., Mikheenko, A., Paten, B., Shumate, A., Soto, D. C., Sović, I., Wood, J. M. D., Zook, J. M., Phillippy, A. M. & Rhie, A., июн 2022, в: Nature Methods. 19, 6, стр. 687-695 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  8. IsoQuant: a tool for accurate novel isoform discovery with long reads

    Prjibelski, A., Mikheenko, A., Joglekar, A., Smetanin, A., Jarroux, J., Lapidus, A. & Tilgner, H. U., 26 апр 2022, (Электронная публикация перед печатью) в: Nature Biotechnology.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  9. Complete genomic and epigenetic maps of human centromeres

    T2T consortium, 1 апр 2022, в: Science. 376, 6588, eabl4178.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  10. Sequencing of individual barcoded cDNAs using Pacific Biosciences and Oxford Nanopore Technologies reveals platform-specific error patterns

    Mikheenko, A., Prjibelski, A. D., Joglekar, A. & Tilgner, H. U., 1 апр 2022, в: Genome Research. 32, 4, стр. 726-737 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  11. The complete sequence of a human genome

    T2T consortium, 1 апр 2022, в: Science. 376, 6588, стр. 44-53 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  12. 2021
  13. The structure, function and evolution of a complete human chromosome 8

    Logsdon, G. A., Vollger, M. R., Hsieh, P. H., Mao, Y., Liskovykh, M. A., Koren, S., Nurk, S., Mercuri, L., Dishuck, P. C., Rhie, A., de Lima, L. G., Dvorkina, T., Porubsky, D., Harvey, W. T., Mikheenko, A., Kremitzki, M., Graves-Lindsay, T. A., Jain, C., Hoekzema, K., Murali, S. C. еще 11, Munson, K. M., Baker, C., Sorensen, M., Lewis, A. M., Surti, U., Gerton, J. L., Larionov, V., Ventura, M., Miga, K. H., Phillippy, A. M. & Eichler, E. E., 6 мая 2021, в: Nature. 593, 7857, стр. 101-107 7 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  14. 2020
  15. Extending rnaSPAdes functionality for hybrid transcriptome assembly

    Prjibelski, A. D., Puglia, G. D., Antipov, D., Bushmanova, E., Giordano, D., Mikheenko, A., Vitale, D. & Lapidus, A., 24 июл 2020, в: BMC Bioinformatics. 21, Suppl 12, стр. 302 9 стр., 302.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  16. TandemTools: mapping long reads and assessing/improving assembly quality in extra-long tandem repeats

    Mikheenko, A., Bzikadze, A., Gurevich, A., Miga, K. & Певзнер, П. А., 1 июл 2020, в: Bioinformatics. 36, 1, стр. i75–i83

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  17. 2019
  18. MetaMiner: A Scalable Peptidogenomics Approach for Discovery of Ribosomal Peptide Natural Products with Blind Modifications from Microbial Communities

    Cao, L., Gurevich, A., Alexander, K. L., Naman, C. B., Leão, T., Glukhov, E., Luzzatto-Knaan, T., Vargas, F., Quinn, R., Bouslimani, A., Nothias, L. F., Singh, N. K., Sanders, J. G., Benitez, R. A. S., Thompson, L. R., Hamid, M. N., Morton, J. T., Mikheenko, A., Shlemov, A., Korobeynikov, A. еще 8, Friedberg, I., Knight, R., Venkateswaran, K., Gerwick, W. H., Gerwick, L., Dorrestein, P. C., Pevzner, P. A. & Mohimani, H., 18 дек 2019, в: Cell Systems. 9, 6, стр. 600-608.e4 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  19. Extending rnaSPAdes functionality for hybrid transcriptome assembly

    Prjibelski, A., Bushmanova, E., Giordano, D., Mikheenko, A., Puglia, G., Antipov, D., Viatale, D. & Lapidus, A., 8 ноя 2019, в: BMC Bioinformatics. 20, S17, 2 стр., O9.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхтезисыРецензирование

  20. Assembly Graph Browser: interactive visualization of assembly graphs

    Mikheenko, A. & Kolmogorov, M., 15 сен 2019, в: Bioinformatics. 35, 18, стр. 3476-3478 3 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  21. 2018
  22. Dereplication of microbial metabolites through database search of mass spectra

    Mohimani, H., Гуревич, А. А., Шлемов, А. Ю., Михеенко, А. А., Коробейников, А. И., Cao, L., Щербин, Е., Nothias, L-F., Dorrestein, P. C. & Певзнер, П. А., 1 дек 2018, в: Nature Communications. 9, 1, 12 стр., 4035.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  23. Versatile genome assembly evaluation with QUAST-LG

    Mikheenko, A., Prjibelski, A., Saveliev, V., Antipov, D. & Gurevich, A., 1 июл 2018, в: Bioinformatics. 34, 13, стр. i142-i150 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  24. Increased diversity of peptidic natural products revealed by modification-tolerant database search of mass spectra

    Гуревич, А. А., Михеенко, А. А., Шлемов, А. Ю., Коробейников, А. И., Mohimani, H. & Певзнер, П. А., 1 мар 2018, в: Nature Microbiology. 3, 3, стр. 319-327 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  25. 2017
  26. Dereplication of peptidic natural products through database search of mass spectra

    Mohimani, H., Gurevich, A., Mikheenko, A., Garg, N., Nothias, L. F., Ninomiya, A., Takada, K., Dorrestein, P. C. & Pevzner, P. A., 1 янв 2017, в: Nature Chemical Biology. 13, 1, стр. 30-37 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  27. 2016
  28. Icarus: Visualizer for de novo assembly evaluation

    Mikheenko, A., Valin, G., Prjibelski, A., Saveliev, V. & Gurevich, A., 1 ноя 2016, в: Bioinformatics. 32, 21, стр. 3321-3323 3 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

Назад 1 2 Далее

ID: 174875