WebQUAST: online evaluation of genome assemblies

Михеенко, А. А., Савельев, В. В., Hirsch, P. & Гуревич, А. А., 17 мая 2023, в: Nucleic Acids Research. 51, W1, стр. 601-606 6 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Versatile genome assembly evaluation with QUAST-LG

Mikheenko, A., Prjibelski, A., Saveliev, V., Antipov, D. & Gurevich, A., 1 июл 2018, в: Bioinformatics. 34, 13, стр. i142-i150 9 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

The structure, function and evolution of a complete human chromosome 8

Logsdon, G. A., Vollger, M. R., Hsieh, P. H., Mao, Y., Liskovykh, M. A., Koren, S., Nurk, S., Mercuri, L., Dishuck, P. C., Rhie, A., de Lima, L. G., Dvorkina, T., Porubsky, D., Harvey, W. T., Mikheenko, A., Kremitzki, M., Graves-Lindsay, T. A., Jain, C., Hoekzema, K., Murali, S. C. еще 11, Munson, K. M., Baker, C., Sorensen, M., Lewis, A. M., Surti, U., Gerton, J. L., Larionov, V., Ventura, M., Miga, K. H., Phillippy, A. M. & Eichler, E. E., 6 мая 2021, в: Nature. 593, 7857, стр. 101-107 7 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

The complete sequence of a human genome

T2T consortium, 1 апр 2022, в: Science. 376, 6588, стр. 44-53 10 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

TandemTools: mapping long reads and assessing/improving assembly quality in extra-long tandem repeats

Mikheenko, A., Bzikadze, A., Gurevich, A., Miga, K. & Певзнер, П. А., 1 июл 2020, в: Bioinformatics. 36, 1, стр. i75–i83

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Single-nuclei isoform RNA sequencing unlocks barcoded exon connectivity in frozen brain tissue

Hardwick, S. A., Hu, W., Joglekar, A., Fan, L., Collier, P. G., Foord, C., Balacco, J., Lanjewar, S., Sampson, M. M. G., Koopmans, F., Prjibelski, A. D., Mikheenko, A., Belchikov, N., Jarroux, J., Lucas, A. B., Palkovits, M., Luo, W., Milner, T. A., Ndhlovu, L. C., Smit, A. B. еще 10, Trojanowski, J. Q., Lee, V. M. Y., Fedrigo, O., Sloan, S. A., Tombácz, D., Ross, M. E., Jarvis, E., Boldogkői, Z., Gan, L. & Tilgner, H. U., июл 2022, в: Nature Biotechnology. 40, 7, стр. 1082-1092 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Sequencing of individual barcoded cDNAs using Pacific Biosciences and Oxford Nanopore Technologies reveals platform-specific error patterns

Mikheenko, A., Prjibelski, A. D., Joglekar, A. & Tilgner, H. U., 1 апр 2022, в: Genome Research. 32, 4, стр. 726-737 12 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

MetaQUAST: evaluation of metagenome assemblies.

Mikheenko, A., Saveliev, V. & Gurevich, A., 2016, в: Bioinformatics. 32, 7, стр. 1088-1090

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

MetaMiner: A Scalable Peptidogenomics Approach for Discovery of Ribosomal Peptide Natural Products with Blind Modifications from Microbial Communities

Cao, L., Gurevich, A., Alexander, K. L., Naman, C. B., Leão, T., Glukhov, E., Luzzatto-Knaan, T., Vargas, F., Quinn, R., Bouslimani, A., Nothias, L. F., Singh, N. K., Sanders, J. G., Benitez, R. A. S., Thompson, L. R., Hamid, M. N., Morton, J. T., Mikheenko, A., Shlemov, A., Korobeynikov, A. еще 8, Friedberg, I., Knight, R., Venkateswaran, K., Gerwick, W. H., Gerwick, L., Dorrestein, P. C., Pevzner, P. A. & Mohimani, H., 18 дек 2019, в: Cell Systems. 9, 6, стр. 600-608.e4 13 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

IsoQuant: a tool for accurate novel isoform discovery with long reads

Prjibelski, A., Mikheenko, A., Joglekar, A., Smetanin, A., Jarroux, J., Lapidus, A. & Tilgner, H. U., 26 апр 2022, (Электронная публикация перед печатью) в: Nature Biotechnology.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование