Методами квантовой химии и лиганд_рецепторного докинга показано, что фосфотиоатный аналог 3':5'_AMP (Rp_3':5'_AMPS) препятствует смещению амидной группы A326, наблюдаемому при переходе B_домена регуляторной субъединицы протеинкиназы A Iα из H_ в B_конформацию, и блокирует таким образом начальные этапы работы гидрофобного переключателя. В соответствии с предложенной гипотезой связывание Rp_3’:5’_AMPS, как и 3':5'_AMP, сопровождается образованием водородной связи с амидной группой A326, однако параметры этой связи в совокупности с положением атома серы делают движение A326 невозможным. В результате Rp_3':5'_AMPS_связанный домен оказывается «запертым» в H_конформации, что и подтверждается данными рентгеноструктурного анализа
Original languageRussian
Pages (from-to)578-582
JournalБИОХИМИЯ
Volume77
Issue number5
StatePublished - 2012

ID: 5406600