TY - JOUR

T1 - Hydrodynamic radius of dendrimers in solvents

AU - Хуснутдинова, Наира Рустемовна

AU - Маркелов, Денис Анатольевич

PY - 2023/9/29

Y1 - 2023/9/29

N2 - Диффузионные свойства и гидродинамический радиус макромолекул Rh важны для теоретических исследований и практического применения. Кроме того, сравнение значений Rh, полученных в результате моделирования и экспериментальных данных, используется для проверки правильности результатов моделирования. Здесь мы изучаем трансляционную подвижность поли(бутилкарбосилановых) дендримеров в растворе хлороформа с использованием молекулярно-динамического моделирования и рассматриваем детали моделирования, которые могут повлиять на точность результата. Обсуждаются различные методы оценки Rh для дендримера в сравнении с нашими экспериментальными данными. Показано, что традиционный метод МД-моделирования для извлечения коэффициента диффузии (и расчета Rh) дендримеров, как правило, сталкивается с трудностями и требует ресурсов моделирования в несколько раз больших, чем, например, для линейного аналога. В большинстве работ по МД-моделированию коэффициент диффузии и/или Rh рассчитывается неправильно. Также установлено, что коррекция Rh по моделированию или оценка Rh по радиусу инерции не дает значений, близких к экспериментальным данным. Чтобы избежать упомянутых проблем, мы нашли альтернативный путь: рассмотреть вращательную диффузию, которая дает Rh, аналогичный экспериментальному, и практически не зависит от размера окна моделирования и других параметров моделирования.

AB - Диффузионные свойства и гидродинамический радиус макромолекул Rh важны для теоретических исследований и практического применения. Кроме того, сравнение значений Rh, полученных в результате моделирования и экспериментальных данных, используется для проверки правильности результатов моделирования. Здесь мы изучаем трансляционную подвижность поли(бутилкарбосилановых) дендримеров в растворе хлороформа с использованием молекулярно-динамического моделирования и рассматриваем детали моделирования, которые могут повлиять на точность результата. Обсуждаются различные методы оценки Rh для дендримера в сравнении с нашими экспериментальными данными. Показано, что традиционный метод МД-моделирования для извлечения коэффициента диффузии (и расчета Rh) дендримеров, как правило, сталкивается с трудностями и требует ресурсов моделирования в несколько раз больших, чем, например, для линейного аналога. В большинстве работ по МД-моделированию коэффициент диффузии и/или Rh рассчитывается неправильно. Также установлено, что коррекция Rh по моделированию или оценка Rh по радиусу инерции не дает значений, близких к экспериментальным данным. Чтобы избежать упомянутых проблем, мы нашли альтернативный путь: рассмотреть вращательную диффузию, которая дает Rh, аналогичный экспериментальному, и практически не зависит от размера окна моделирования и других параметров моделирования.

KW - дендример

KW - раствор

KW - гидродинамический радиус

KW - диффузия

UR - https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2023/CP/D3CP03382A

UR - https://www.mendeley.com/catalogue/0f361b47-4b95-32a3-b5f8-07ba330402fc/

U2 - 10.1039/d3cp03382a

DO - 10.1039/d3cp03382a

M3 - Article

VL - 25

SP - 28220

EP - 28229

JO - Physical Chemistry Chemical Physics

JF - Physical Chemistry Chemical Physics

SN - 1463-9076

IS - 41

ER -