Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Hydrodynamic radius of dendrimers in solvents. / Хуснутдинова, Наира Рустемовна; Маркелов, Денис Анатольевич.
In: Physical Chemistry Chemical Physics, Vol. 25, No. 41, 29.09.2023, p. 28220–28229.Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
}
TY - JOUR
T1 - Hydrodynamic radius of dendrimers in solvents
AU - Хуснутдинова, Наира Рустемовна
AU - Маркелов, Денис Анатольевич
PY - 2023/9/29
Y1 - 2023/9/29
N2 - Диффузионные свойства и гидродинамический радиус макромолекул Rh важны для теоретических исследований и практического применения. Кроме того, сравнение значений Rh, полученных в результате моделирования и экспериментальных данных, используется для проверки правильности результатов моделирования. Здесь мы изучаем трансляционную подвижность поли(бутилкарбосилановых) дендримеров в растворе хлороформа с использованием молекулярно-динамического моделирования и рассматриваем детали моделирования, которые могут повлиять на точность результата. Обсуждаются различные методы оценки Rh для дендримера в сравнении с нашими экспериментальными данными. Показано, что традиционный метод МД-моделирования для извлечения коэффициента диффузии (и расчета Rh) дендримеров, как правило, сталкивается с трудностями и требует ресурсов моделирования в несколько раз больших, чем, например, для линейного аналога. В большинстве работ по МД-моделированию коэффициент диффузии и/или Rh рассчитывается неправильно. Также установлено, что коррекция Rh по моделированию или оценка Rh по радиусу инерции не дает значений, близких к экспериментальным данным. Чтобы избежать упомянутых проблем, мы нашли альтернативный путь: рассмотреть вращательную диффузию, которая дает Rh, аналогичный экспериментальному, и практически не зависит от размера окна моделирования и других параметров моделирования.
AB - Диффузионные свойства и гидродинамический радиус макромолекул Rh важны для теоретических исследований и практического применения. Кроме того, сравнение значений Rh, полученных в результате моделирования и экспериментальных данных, используется для проверки правильности результатов моделирования. Здесь мы изучаем трансляционную подвижность поли(бутилкарбосилановых) дендримеров в растворе хлороформа с использованием молекулярно-динамического моделирования и рассматриваем детали моделирования, которые могут повлиять на точность результата. Обсуждаются различные методы оценки Rh для дендримера в сравнении с нашими экспериментальными данными. Показано, что традиционный метод МД-моделирования для извлечения коэффициента диффузии (и расчета Rh) дендримеров, как правило, сталкивается с трудностями и требует ресурсов моделирования в несколько раз больших, чем, например, для линейного аналога. В большинстве работ по МД-моделированию коэффициент диффузии и/или Rh рассчитывается неправильно. Также установлено, что коррекция Rh по моделированию или оценка Rh по радиусу инерции не дает значений, близких к экспериментальным данным. Чтобы избежать упомянутых проблем, мы нашли альтернативный путь: рассмотреть вращательную диффузию, которая дает Rh, аналогичный экспериментальному, и практически не зависит от размера окна моделирования и других параметров моделирования.
KW - дендример
KW - раствор
KW - гидродинамический радиус
KW - диффузия
UR - https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2023/CP/D3CP03382A
UR - https://www.mendeley.com/catalogue/0f361b47-4b95-32a3-b5f8-07ba330402fc/
U2 - 10.1039/d3cp03382a
DO - 10.1039/d3cp03382a
M3 - Article
VL - 25
SP - 28220
EP - 28229
JO - Physical Chemistry Chemical Physics
JF - Physical Chemistry Chemical Physics
SN - 1463-9076
IS - 41
ER -
ID: 113384119